本文将介绍双端测序数据的FastQC质控代码。 1.导入双端测序数据 在FastQC中,我们需要将双端测序数据导入到软件中进行分析。我们可以通过以下代码将双端测序数据导入: fastqc -f fastq -noextract -t 8 -o output_dir read1.fastq.gz read2.fastq.gz 其中,-f fastq表示输入文件格式为fastq;-noextract表示不...
fastqc是一款开源软件,可以在其官方网站上免费下载。安装完成后,可以在命令行中直接调用fastqc命令进行测序数据的质控。 二、双端测序的fastqc质控代码 双端测序的fastqc质控代码主要包括以下几个步骤: 1.指定输入文件路径 在进行fastqc质控之前,需要先指定输入文件的路径。双端测序通常会得到两个文件,分别对应两端的测序...