尤其是“DNA元件百科全书”计划(ENCODE project)实施以来。对于蛋白质编码基因,它们的大部分转录产物(信使RNA)都… zhidao.baidu.com|基于 1 个网页 2. 解码后续计画 ...床效益是一项极为复杂工作,且方法未臻完善,即使基因解码后续计画(ENCODE project) 指出,人类序列中富含大量的不转 … ...
背景资料 ENCODE 计划自2003 年9 月正式启动（ENCODE Project Consortium，2012），吸引了来自美国、英国、西班牙、日本和新加坡等5 个国家的32 个研究机构、440 多名科学家共同参与。迄今为止，该计划研究了147 个组织类型，进行了1478 次实验，获得并分析了超过15 万亿字节的原始数据，确定了400 万个基因开关，明确...
随着不断发展,后来又陆续整合了modENCODE等多个项目的数据,对数据库进一步扩充,增加了小鼠,果蝇,线虫等数据。该项目的所有数据可以通过以下链接进行查询 https://www.encodeproject.org/ 点击Data->Matrix按钮,可以看到如下所示的结果,在左侧的筛选框可以根据多种条件进行...
https://www.encodeproject.org/ 点击Data->Matrix按钮,可以看到如下所示的结果,在左侧的筛选框可以根据多种条件进行筛选 筛选完成后,点击右侧矩阵中的数字,可以查看筛选到的数据集。以转录因子CTCF的chip_seq数据为例,结果如下 对于每个数据集,提供了以下结果 1. 基本信息 给出了数据类型,样本对应的细胞系和组织...
随着不断发展,后来又陆续整合了modENCODE等多个项目的数据,对数据库进一步扩充,增加了小鼠,果蝇,线虫等数据。该项目的所有数据可以通过以下链接进行查询 https://www./ 点击Data->Matrix按钮,可以看到如下所示的结果,在左侧的筛选框可以根据多种条件进行筛选 ...
ENCODE project 向日葵花向阳开 把时间和精力花在有意义的事情上。1 人赞同了该文章 项目开始的原因: 当时主要是转录层面的研究,为了获得一些其他组学的数据。 目的: 弄清楚基因组里面的一些区段的调控元件和编码基因以及非编码RNA之间复杂的相互作用。 第一阶段: Tilling array:把整个基因组设计探针进行覆盖,检测基...
Farnham, Peggy JThe ENCODE project. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature 489, 57-74 (2012).DE SOUZA, N. (2012) The ENCODE project. Nat Methods 9(11),1046.
同时,通过整合与基因调控相关的DNA元件的注释,ENCODE计划的第三阶段还开发了一个顺式调控元件相关注释信息表并构建了一个网站(SCREEN; screen.encodeproject.org),提供对该资源灵活的、用户定义的访问。 总的来说,蛋白质编码与非编码基因数据与顺式调控元件注释信息表为科学界建立对人类和小鼠基因组组织和功能的更好...
This overview of the ENCODE project outlines the data accumulated so far, revealing that 80% of the human genome now has at least one biochemical function assigned to it; the newly identified functional elements should aid the interpretation of results of genome-wide association studies, as many ...