single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing (scATAC-seq) 数据在PRJNA768891,我优先选择了去ENA数据库下载它,因为sratoolkit的prefetch命令下载sra文件速度太慢,可以参考:使用ebi数据库直接下载fastq测序数据, 需要自行配置好conda环境,然后去EBI里面搜索到...
ExpressionSet for RNA-Seq experiment submitted in ArrayExpress and ENAAndrew Tikhonov
single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing (scATAC-seq) 数据在PRJNA768891,我优先选择了去ENA数据库下载它,因为sratoolkit的prefetch命令下载sra文件速度太慢,可以参考:使用ebi数据库直接下载fas...
RNA-Seq 10090 Mus musculus RNA-Seq TRANSCRIPTOMIC cDNA SRS1467642 Illumina HiSeq 2500 2676053 101904264 SRR3587911 2676053 133802650 SRP075720 SRX1800474 GSM2177567: Kcng4_2la_H7; Mus musculus; RNA-Seq GSM2177567: Kcng4_2la_H7; Mus musculus; RNA-Seq 10090 Mus musculus RNA-Seq TRANSCRIPTOMIC ...
RNA-seq(2)-1:原始数据下载的几种方法 其他 第1选择--Aspera Connect 如果aspera connect不能下载,推荐sratoolkit的prefetch功能。尽量不要用wget或curl下载,速度慢,且有时下载不完全 Y大宽 2018/09/10 5K0 iSeq:GSA-SRA-ENA-GEO-DDBJ 数据下载一网打尽 数据库geo数据线程压缩 最近需要下载些公共数据,在简...
as shown by our RNA-seq data. Furthermore, the last intron ofenaCis not processed, adding 13 codons to the sequence but without altering the reading frame. The corresponding set of 13 amino acids is part of the fifth transmembrane domain. The corrected EnaC sequence, including the additional ...
在RNA-Seq分析中,"base count"可以用来评估某个基因或转录本的表达水平。通过对测序得到的reads进行比对和计数,可以得到每个基因或转录本的raw read count,然后通过一定的标准化方法(如FPKM、RPKM或TPM)来调整测序深度和基因长度的影响,从而得到一个相对的表达水平。
ENA测序数据探针信息获取 ENA(european nucleotide achive)数据库下载的RNAseq数据,怎么获取探针对应基因信息呢。哪位大神能解救一下(Illunima HiSeq2500 平台的测序)。膝盖和软妹币都可以,只要大神能解决。
single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing (scATAC-seq) 数据在PRJNA768891,我优先选择了去ENA数据库下载它,因为sratoolkit的prefetch命令下载sra文件速度太慢,可以参考:使用ebi数据库直接下载fastq测序数据, 需要自行配置好conda环境,然后去EBI里面搜索到...
Strategy:"amplicon"扩增子,"rna seq","mirna seq" Show index list 1.1.2 结果 Fig3.PNG 这些数据可以直接下载,但如果是双端测序数据,这种下载方式得到的后缀名为gz的文件其实是两个文件。数据量小可以去https://usegalaxy.org/拆分,数据量大使用fastp拆分。 1.2 ENA数据库 European Nucleotide Archivehttps:/...