签名是由多个序列比对构建的数学模型,可用于对蛋白质进行分类。 相较于成对的序列相似性搜索(例如BLAST),使用蛋白质签名通常是鉴定蛋白质功能的更为灵敏的方法。 不同类型的签名使用不同的方法,着重于单个基序(模式),多个基序(指纹)或考虑整体比对(Profile和HMM),它们在蛋白质序列分析方面提供了独特的优势,可用于将...
其数据获取工具SRS，如FASTA、BLAST和WU-BLAST，提供便捷的序列搜索和多种生物数据分析功能，如蛋白功能分析和结构分析。欧洲生物信息研究所的科研环境独特且质量上乘，是EMBL不可或缺的研究分支。研究团队和服务团队相互促进，一方面通过研究开发新的生物数据解释方法，另一方面在维护现有资源的同时，不断研发...
Better at finding proteins with common function Find more distant homologues than BLAST Better at finding proteins with common function Classification of proteins Associate proteins that share: Function Domains Sequence Structure Annotation of protein sequences Define conserved regions of a protein e.g. l...
These include sequence similarity search services (https://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/) such as BLAST, FASTA ... W Li,C Andrew,U Mahmut,... - 《Nucleic Acids Research》 被引量: 466发表: 2015年 The European Bioinformatics Institute's data resources The wide uptake of next-generation ...
(e.g. FASTA and NCBI BLAST), multiple sequence alignment (e.g. Clustal Omega and MUSCLE), pairwise sequence alignment and protein functional analysis (e.g. InterProScan and Phobius). The REST/SOAP Web Services (http://www.ebi.ac.uk/Tools/webservices/) interfaces to these databases and ...
The EMBL-EBI provides access to various mainstream sequence analysis applications. These include sequence similarity search services such as BLAST, FASTA, ... G Mickael,McWilliam Hamish,W Li,... - 《Nucleic Acids Research》 被引量: 2133发表: 2010年 ...
序列数据搜索包括FASTA、 NCBI BLAST和WU-BLAST序列同源性和相似性对比工具。其它还包括蛋白功能分析，序列多重排比，进化树分析，大分子结构分析与多维显示等。研究兴趣 欧洲生物信息研究所为生物信息学提供了一个优质而独特的研究环境。该所研究兴趣广泛，研究与服务相辅相成。作为一个EMBL不可分割的一部分, 欧洲生物...