EBI维护着世界上最广泛的生物分子数据资源,包括EMBL-Bank(DNA和RNA序列)、Ensembl(基因组)、ArrayExpress(微阵列基因表达)、UniProt(蛋白质序列和注释)、interPro(蛋白质家族、结构域和基序)、Reactome(细胞通路)、ChEBI(小分子)等数据库。EMBL-EBI具有开放性、兼容性、综合性的特点,并使用专家注释系统提高数据质量。
。可以利用序列查询系统 SRS(Sequence Retrieval System)从EMBL数据库中提取有关信息(Etzold等,1996年)。SRS序列查询系统通过超文本链接将DNA序列数据库和蛋白质序列、功能位点、结构、基因图谱以及文献摘要MEDLINE等各种数据库联系在一起。利用EBI网站提供的BLAST或FastA程序,可以对EMBL数据库进行未知序列同源性搜索。
用户可以通过序列查询系统SRS(Sequence Retrieval System)从EMBL数据库中提取相关信息。SRS通过超文本链接将DNA序列数据库与蛋白质序列、功能位点、结构、基因图谱以及文献摘要MEDLINE等各种数据库联系起来。EBI网站还提供了BLAST或FastA程序,使用户能够对EMBL数据库进行未知序列同源性搜索。随着生物信息学的发展,...
欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI),全称为European Bioinformatics Institute,是一个非营利性学术机构,致力于通过信息学手段推动生命科学领域的探索。成立于1994年,坐落在英国剑桥南部的维康信托基因园,隶属于欧洲分子生物学实验室(EMBL)。研究所的核心任务包括:建立和维护生物学数据库,为全球科学界提供...
InterPro是EBI进行蛋白质分类的主要资源。 在InterPro中,将来自多个不同数据库的模式,Profile,指纹和HMM整合到一个可搜索的资源中,从而可以方便地访问其预测功能,而无需单独访问成员数据库(请参见图18的概述,用于构建InterPro的数据库)。 通过组合不同的数据库和签名类型(signature types),InterPro可以利用其各自的...
The EMBL-EBI bioinformatics web and programmatic tools framework Since 2009 the EMBL-EBI Job Dispatcher framework has provided free access to a range of mainstream sequence analysis applications. These include sequence similarity search services (https://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/) such as BLAST, FA...
址为http:Ilsrs .ebi .ac.uk/。 同其 它分子生物学专 业数据库一样,SRS 可链接到主要的核酸和蛋白 质数据库 ,序列检索时 ,可使用多种工具 ( 如 FAS— TA、BLAST) 使用户提交的序列与 EMBL 数据库的 序列进行对照 ,所有的数据资源均可通过 EBI 的 主页进 行存取 。蛋 白质 序列检 索可 通过...
查询EMBL的工具包括Sequence Retrieval System (SRS),它通过超链接将DNA序列与其他类型的数据,如蛋白质序列、功能位点、结构信息、基因图谱以及MEDLINE文献摘要等无缝连接。此外,EBI的网站还提供了BLAST和FastA程序,用户可以利用这些工具对未知序列进行同源性搜索,以探索其在生物学中的潜在关联。
System)序列查询系统获取相关信息。SRS将DNA序列数据库与其他重要数据库如蛋白质序列、功能位点、结构、基因图谱以及MEDLINE文献摘要等通过超文本链接连接起来,方便用户查询。此外,EBI网站还提供了BLAST或FastA程序,用户可以通过这些工具对EMBL数据库中的未知序列进行同源性搜索,以进行深入的生物信息学分析。