InterPro是EBI进行蛋白质分类的主要资源。 在InterPro中,将来自多个不同数据库的模式,Profile,指纹和HMM整合到一个可搜索的资源中,从而可以方便地访问其预测功能,而无需单独访问成员数据库(请参见图18的概述,用于构建InterPro的数据库)。 通过组合不同的数据库和签名类型(signature types),InterPro可以利用其各自的...
具体课程表,大家自己浏览:ebi.ac.uk/training/even 目前我们生信技能树并没有蛋白质组学的视频教程,只有一个学习小组,和10个推文教程,如下: 蛋白质组学第1期-认识基础概念 蛋白质组学第2期-认识蛋白质组学原始数据 蛋白质组学第3期-蛋白质组学的三大元素 蛋白质组学第4期 文章搜库过程复现 蛋白质组学第5...
【5】The EBI RDF platform: Jupp et al., Bioinformatics (2014), 30(9), 1338-9 【6】Info on half maximal inhibitory concentration: (p)IC50 【7】UniProt website
ChEMBL 数据库是一个开放式大型生物活性数据库，提供超过190万种化合物的数据，并与约13,000个靶标相对应。数据来源广泛，包括科学文献、PubChem 生物测定、被忽视疾病药物倡议 (DNDi)、BindingDB 数据库等。用户可以通过网络界面、EBI-RDF 平台和 ChEMBL 网络资源客户端访问 ChEMBL 数据。ChEMBL 网络...
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How to combine tools to create an analysis workflow 具体课程表,大家自己浏览:https://www./training/events/2020/introduction-metabolomics-analysis-1 十年无数课程 详见:https://www./training/10-years 3年前我分享的时候:EMBL-EBI 持续十年提供免费的生物信息学培训,是他们的十周年纪念日...
UniProt主要由SIB的Swiss-prot和EBI的TrEMBL两部分构成,它们两者的区别如下: UniProtKB/ SWISS-PROT:该数据库的所有蛋白质都经过有经验的分子生物学家或蛋白化学家通过电脑软件或者文献验证过的,它可作为蛋白质数据库的金标准。 UniProtKB/TrEMBL:EBI通过生物信息软件翻译EMBL所有的可编码的核酸序列得到的数据库,它可作...
具体课程表,大家自己浏览:https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/proteomics-bioinformatics-4 目前我们生信技能树并没有蛋白质组学的视频教程,只有一个学习小组,和10个推文教程,如下: 蛋白质组学第1期-认识基础概念 蛋白质组学第9期 文章数据分析之差异蛋白筛选和功能分析 ...