ebi.ac.uk/QuickGO/ 使用QuickGO还是相对简单的,直接搜索就可以了。 在主页搜索框可以搜索GO(按名称或ID)、ECO(按名称或ID)和基因名称,实际上可以使用多种不同的标识符类型来查询QuickGO(包括:DictyBase,UniGene,UniProtKB,FlyBase,Gramene和NCBI Entrez基因标识符)。检索时支持自动联想,可以根据输入数据自动匹配相...
欧洲核苷酸数据库（EMBL-EBI）：欧洲核苷酸数据库是由欧洲生物信息学研究所（European Bioinformatics Institute，EMBL-EBI）管理的数据库之一，成立于1980年代末期。它收集了来自欧洲和其他地区的大量核苷酸序列数据，包括基因组、转录组、蛋白质序列等信息。日本DNA数据银行（DDBJ）：日本DNA数据银行是由日本国立遗传学研究...
其中，EBI的QuickGO数据库专注于人类蛋白功能的Gene Ontology（GO）分析，它将蛋白质或基因通过ID或序列注释关联到分子功能、生物过程和细胞组成三个维度的GO分类。QuickGO与实验室研究，如Exocarta和Vesiclepedia等数据库紧密相连，还包括了对外泌体实验方法学的注释。此外，它还参与了外来基因本体论注释倡议...
How to combine tools to create an analysis workflow 具体课程表,大家自己浏览:https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/introduction-metabolomics-analysis-1 十年无数课程 详见:https://www.ebi.ac.uk/training/10-years 文末友情宣传 强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI,多一点数据认知,让他...
ChEMBL 数据库是一个开放式大型生物活性数据库，提供超过190万种化合物的数据，并与约13,000个靶标相对应。数据来源广泛，包括科学文献、PubChem 生物测定、被忽视疾病药物倡议 (DNDi)、BindingDB 数据库等。用户可以通过网络界面、EBI-RDF 平台和 ChEMBL 网络资源客户端访问 ChEMBL 数据。ChEMBL 网络...
InterPro是EBI进行蛋白质分类的主要资源。 在InterPro中,将来自多个不同数据库的模式,Profile,指纹和HMM整合到一个可搜索的资源中,从而可以方便地访问其预测功能,而无需单独访问成员数据库(请参见图18的概述,用于构建InterPro的数据库)。 通过组合不同的数据库和签名类型(signature types),InterPro可以利用其各自的...
百度试题 题目三大核酸序列数据库为GenBank、EMBL-EBI、OMIM。 A.正确B.错误相关知识点: 试题来源: 解析 B 反馈 收藏
数据库提供了多种输入方式: 1)输入序列来进行比对查看具体是哪个蛋白家族的; 2)可以输入蛋白相关的结果:结构域; 3) 也可以通过检测词来检索符合要求的蛋白家族信息; 4)同时可以基于物种来见来查找某一物种的所有蛋白家族信息。 应用举例: 如果查询想要使用和凋亡相关的有哪些蛋白,就在关键词检索里面输入:apoptosis...
除了PIR,另一个重要的 蛋白质序列数据库是SWISS-PROT(Protein Sequence Database) (http://www. expasy. ch/sprot/ sprot- top. htmil)。该数据库由瑞士日内瓦大学生化系A. Bairoch于1986年创建,目前由瑞土生物信息学研究所 (Swiss Institute of Bioinformatics, SIB)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同维护和...
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