因此,我们选用Aspera软件,从EBI(European Bioinformatics Institute)的ENA(European Nucleotide Archive)数据库直接下载FASTQ格式文件。这样做的好处是使得下载速度有了很大程度上的提升。 安装miniconda mkdir -p ~/miniconda3 wget https://nas.wyk.hk:99/bioinfo/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64-20231118.sh...
ENA数据库:European Nucleotide Archive:隶属EBI (European Bioinformatics Institute),功能等同SRA,并且对保存的数据做了注释,界面相对于SRA更友好,对于有数据需求的研究人员来说,ENA数据库最诱人的点应该是可以直接下载fastq (.gz)文件,由 EBI 负责维护。 两者在主要功能方面非常类似,同时数据互通。 sra文件下载方式 ...
ENAbrowser: "The European Nucleotide Archive (ENA) captures and presents information relating to experimental workflows that are based around nucleotide sequencing. A typical workflow includes the isolation and preparation of material for sequencing, a run of a sequencing machine in which sequencing data...
EBI Metagenomics portal Submitting metagenomics data to the European Nucleotide ArchiveH Denise
ENA数据库:European Nucleotide Archive:隶属EBI (European Bioinformatics Institute),功能等同SRA,并且对保存的数据做了注释,界面相对于SRA更友好,对于有数据需求的研究人员来说,ENA数据库最诱人的点应该是可以直接下载fastq (.gz)文件,由 EBI 负责维护。
ENA数据库:European Nucleotide Archive:隶属EBI (European Bioinformatics Institute),功能等同SRA,并且对保存的数据做了注释,界面相对于SRA更友好,对于有数据需求的研究人员来说,ENA数据库最诱人的点应该是可以直接下载fastq (.gz)文件,由 EBI 负责维护。
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