在ggplot2中向DotPlot添加均值和胡须(误差线)可以通过以下步骤实现: 基础概念 DotPlot:一种用于展示数据分布的图表类型,通过点的位置表示数据的值。 均值:数据的平均值,用于表示数据的中心趋势。 胡须(误差线):用于表示数据的变异性或不确定性,通常包括标准差、标准误或置信区间。
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+geom_point(aes(size=`Percent expressed`,color=`Average expression`))+theme_bw()+theme(panel.grid=element_blank(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5))+scale_color_gradient(low="lightgrey",high="blue")+labs(x=NULL,y=NULL...
步骤3:使用ggplot2包创建Dotplot 通过ggplot函数开始构建图形,使用geom_dotplot添加点。 # 创建Dotplotdotplot<-ggplot(data,aes(x=类别,y=值))+# 定义x轴和y轴geom_dotplot(binaxis='y',stackdir='center',dotsize=1)+# 添加点图labs(title="Dotplot示例",x="类别",y="值")# 添加标题和标签 1. ...
Dot Plot 英文:http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-dot-plot-quick-start-guide-r-software-and-data-visualization 根据说明文档,运行代码…… #convert the variable dose from a numeric to a factor variableToothGrowth$dose<-as.factor(ToothGrowth$dose)head(ToothGrowth)#Basic dot plotlibrary(ggplot...
关于单细胞气泡图的做法,我们写过很多很多,但是这些图基本上都是利用Seurat提取了数据,然后在ggplot2中完成的。因为Seurat包中的DotPlot函数的底层就是ggplot2,所以这里我们决定就是用Dotplot函数,然后进行修饰,得到具有NCS质感的图片。 当然了,这篇内容对于高手来说没什么,但是对于一般学习者而言,我们解决的问题有:1...
library(ggplot2) library(Hmisc) #注释:package使用之前需要调用 #今天要用到stat_summary()函数需要调用Hmisc包 Step4.绘图 data_melt<-melt (data[,-1]) #注释:melt()函数把表格中的宽数据变成长数据 # data[,-1]去掉作图用不到的第一列数据 ...
首先，读者可以利用Seurat包的DotPlot函数绘制基本点图，随后，通过调整颜色、大小、方向等参数，进一步美化点图。在Seurat中，可以利用ggplot2的特性，如`coord_flip`实现坐标翻转，通过`theme`调整坐标轴字体和角度，通过`guide`和`scale`调整图例和颜色等。这种调整使得点图更加符合科学文献中的风格，增加...
2. 绘制基础图形 data %>% ggplot(aes(group, value, fill = name)) + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', position=position_dodge(0.9)) 3. 添加errorbar和pointrange data %>% ggplot(aes(group, value, fill = name)) +
ggplot(df, aes(x = id, y = features.plot)) + geom_point(aes(color = avg.exp.scaled, size = pct.exp)) + scale_color_gradientn(colors = c("#BBBBBB","#CC0000"), limits = c(-1.3, 2.5)) + labs(x = "", y = "")+ ...
Step2. 绘图数据的读取 data<-read.csv(“your file path”, header = T) #注释:header=T表示数据中 的第一行是列名,如果没有列名就用header=F Step3.绘图所需 package的安装、调用 install.package(“ggplot2”) #注释:ggplot2是目前公认绘图很强的一个安装包 library(ggplot2) #注释:package在使用之前...