1. RNA切割活性DNA酶(RNA-cleaving DNAzymes,RCD):RCD是一类依赖金属离子作为辅因子的DNA酶,能够结合金属离子如Pb2+、Zn2+等以催化RNA链上磷酸酯键的断裂,实现RNA裂解[16 ]。RCD的模块化结构由底物结合臂和核心催化区组成。底物结合臂通过...
DNAzyme 是一类具有催化功能的 DNA 分子。同蛋白质和 RNA 催化酶一样,DNAzyme 能够催化多种类型的生化反应,并在不对称催化、生物传感器、DNA 纳米技术以及临床诊断方面得到了广泛的应用。具有 RNA 剪切功能的 RNA-cleaving DNAzyme 是发现最早的一类 DNAzyme。因为能够序列特异性地剪切目标 RNA,导致目的基因的沉默,...
在这篇文章中,作者使用RNA-cleaving DNAzymes及荧光蛋白组成传感器,实现了对活生物系统中金属离子的检测以及浓度比例成像。 在DNAzymes的设计中,他们使用了RNA-cleaving DNAzymes。RNA-cleaving DNAzymes可以在特定的位点切开RNA链,其结构包括15nt的...
binding folded RNADNAzymes kineticsselectivity of RNA recognitionCleavage of biological mRNA by DNAzymes (Dz) has been proposed as a variation of oligonucleotide gene therapy (OGT). The design of Dz‐based OGT agents includes computational prediction of two RNA‐binding arms with low affinity (...
2021年12月23日，德国杜塞尔多夫大学Manuel Etzkorn研究组发文题为Time-resolved structural analysis of an RNA-cleaving DNA catalyst，以10-23 DNAzyme作为范例研究了该DNA酶在预催化状态到催化过程中高时空分辨率的分子结构以及可塑性动态变化过程。为了开始这一研究，作者们使用了10-23 DNAzyme，该DNA酶具有催化核心...
RNARNA cleavageEngineering easy‐to 摗爄osensors with ultra﹍ow detection sensitivity remains a major challenge. Herein, we report a simple approach for creating such sensors through the use of an RNAヽleaving DNAzyme (RcD) and a strategy designed to significantly concentrate its cleavage product....
其中有RNA切割作用的10-23 DNAzyme(Dz),以高选择性切割各种 RNA 靶标的能力带来了巨大的治疗和生物技术潜力。 然而,高期望尚未实现,这或许与缺乏其催化状态的高分辨率表征有关。 近期来自德国生物信息处理研究所的Manuel Etzkorn实验室在Nature发表题为“Time-resolved structural analysis of an RNA-cleaving DNA ca...
一个DNAzyme(红色)利用它的结合臂在RNA链(黄色)的特定位置上停靠,然后在其核心将其裂解。利用高分辨率、实时核磁共振、电子顺磁共振、荧光光谱以及分子动力学模拟等方法对DNAzyme的结构和催化机理进行了表征。 脱氧核酶(DNAzymes)脱氧核酶是一种精确的生物催化剂,可以破坏不需要的RNA分子。然而,在医学上使用它们的主要...
一个DNAzyme(红色)利用它的结合臂在RNA链(黄色)的特定位置上停靠,然后在其核心将其裂解。利用高分辨率、实时核磁共振、电子顺磁共振、荧光光谱以及分子动力学模拟等方法对DNAzyme的结构和催化机理进行了表征。 脱氧核酶(DNAzymes)脱氧核酶是一种精确的生物催化剂,可以破坏不需要的RNA分子。然而,在医学上使用它们的主要...
2021年12月23日,德国杜塞尔多夫大学Manuel Etzkorn研究组发文题为Time-resolved structural analysis of an RNA-cleaving DNA catalyst,以10-23 DNAzyme作为范例研究了该DNA酶在预催化状态到催化过程中高时空分辨率的分子结构以及可塑性动态变化过程。 为了开始这一研究,作者们使用了10-23 DNAzyme,该DNA酶具有催化核心...