1. 电荷相互作用 DNA和蛋白质相互作用的一个基本原理是电荷相互吸引。DNA上的磷酸基团带负电荷，而大多数蛋白质中含有带正电荷的氨基酸残基，如赖氨酸、精氨酸等。通过这种静电吸引，在不同的物理条件下，蛋白质可以具体结合到DNA的双螺旋结构上，从而影响DNA的转录和复制等生命活动。2. 氢键相互作用 在DNA和...
染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基因的转录、染色质的空间构型和构象密切相关。运...
下面介绍4种常见的蛋白质与DNA互作的方法。 1. DNA结合蛋白质 DNA结合蛋白质是特殊的蛋白质,它们能够通过与DNA的特定序列结合来实现一系列的生物学功能。这种DNA结合蛋白质具有可变的DNA结合域,这些域可以根据它们所处的生物环境而发生变化,从而使它们能够识别和结合具有特定序列的DNA。这种蛋白质与DNA的相互作用可以...
ChIP 的一般流程是:甲醛固定细胞---收集细胞,将染色质复合物中 DNA 切割---加入目的蛋白的抗体,与靶蛋白-DNA 复合物相互结合---加入Protein A 或 Protein G 微珠,结合抗体-靶蛋白-DNA 复合物并沉淀---对沉淀下来的复合物进行清洗,除去一些非特异性结合---洗脱,得到富集的靶蛋白-DNA 复合物---解交联,纯化...
在研究蛋白质DNA互作时，ChIP（Chromatin Immunoprecipitation）和CUT&Tag（Cleavage Under Target and Tagmentation）都是重要的技术手段。两者各有优缺点，适用于不同的研究场景，以下是对这两种技术的详细比较：ChIP技术 1.原理：ChIP技术的主要目的是研究目的蛋白（包括修饰组蛋白、转录因子、辅因子及其他染色质蛋白）在...
在这篇文章中,我们将介绍蛋白质与DNA互作的四种方法。 1. DNA结合蛋白 DNA结合蛋白是一类能够与DNA结合的蛋白质,它们通过与DNA的特定序列结合来调控基因表达。这些蛋白质可以通过直接与DNA结合来阻止或促进转录因子的结合,从而影响基因的表达。例如,转录因子可以通过与DNA结合来激活或抑制基因的转录,从而影响细胞的功能...
真核生物基因组DNA以染色质形式存在,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达调控机制的基本途径。ChIP-seq是将染色质免疫沉淀技术(ChIP)与新一代测序技术(NGS)相结合[1],能够高效地在全基因组范围内检测与...
一、DNA-蛋白质互作——染色质状态和功能研究 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作(DNA-Protein Interactions,DPIs)是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。 DNA结合...
ChIP是全基因组范围内检测蛋白-DNA互作的标准方法,该技术由Orlando等于1997年创立[1]。 图1:ChIP 基本原理图[1] ✦ChIP原理: 将染色质和与之相互作用的转录因子和组蛋白通过甲醛等物质交联起来,然后通过超声将染色质打碎成小片段,加入针对特定转录因子或特殊修饰的组蛋白抗体,通过Protein A/Protein G微球或磁珠将...