DNA甲基化是在DNA甲基化转移酶(Dnmt)的作用下将甲基选择性地添加到胞嘧啶上形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)的过程。 2.DNA甲基化与基因表达调控 DNA复制后胞嘧啶的甲基化会改变DNA的构象,使DNA的大沟无法与DNA结合蛋白正常结合,从而使这些非编码区长期保持无表达活性的状态。...
DNA甲基化是在DNA甲基化转移酶(Dnmt)的作用下将甲基选择性地添加到胞嘧啶上形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)的过程。 2.DNA甲基化与基因表达调控 DNA复制后胞嘧啶的甲基化会改变DNA的构象,使DNA的大沟无法与DNA结合蛋白正常结合,从而使这些非编码区长期保持无表达活性的状态。而有转录活性的基因可利用非甲基化的启动子来...
随着表观遗传技术的发展,越来越多的表观技术也应用到群体的研究上,特别是DNA甲基化测序(比如WGBS),研究者们通过获得群体的DNA甲基化数据后进行种群DMR分析,与重测序数据关联分析、EWAS分析、meQTL分析获得影响目标性状表型变异的表观遗传标记以及候选基因。 我们先回顾一下重测序的分析策略。首先拿到大量样本(不同群体...
甲基化特异性PCR(MSP)：使用特异性引物扩增甲基化和未甲基化的DNA序列，检测特定区域的甲基化状态。限制性酶切分析：利用甲基化敏感性限制性内切酶切割特定位点，分析甲基化状态。2. 高通量DNA甲基化测序技术 全基因组亚硫酸氢盐测序(Whole-Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)：对全基因组进行亚硫酸氢盐处理和高通量...
DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。DNA甲基化通常抑制基因表达,...
全局甲基化分析是第一种发展起来的分析方法,其目的主要用来确定基因组整体的DNA甲基化水平,局部的甲基化变化是不在考虑范围内的。该方法主要涉及用来源于SAM的放射性甲基供体被甲基转移酶Sss1催化修饰到DNA样品之中。还有利用CpG位点甲基化敏感的限制性内...
本研究通过微量甲基化测序和对应的转录组测序分析等揭示了MeCP2在卵巢中的功能和蛋白质降解机制,表明CRL4DCAF13 E3连接酶靶向MeCP2降解,从而防止DNA高甲基化并保持正常转录的新机制,并预示DCAF13-MeCP2轴异常参与卵巢衰老。深圳市易基因科技为本研究提供微量全基因组重亚硫酸盐测序分析技术服务。
DNA甲基化异常可能揭示疾病状态,包括癌症和神经系统疾病。因此,人类基因组中5-甲基胞嘧啶(5mC)分布和位点是一个重要的研究方向。全基因组重亚硫酸盐测序(Whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)是一种用于分析DNA甲基化的高通量方法,本文综述了WGBS的关键步骤,总结了可用且最新的分析工具,比较了比对算法,并分享了...
在单细胞 DNA 甲基化分析方法中最大限度地减少 DNA 损失的关键策略 RRBS和WGBS是流行的全基因组甲基化分析方法。这两种方法都包括亚硫酸氢盐转化和NGS制备。主要区别在于,RRBS使用适当的限制性内切酶和大小选择来筛选富含GC的区域。WGBS(特别是MethylC-seq)的优势在于能够覆盖基因组中的大部分CpGs。与RRBS相比,WGBS的...
the Development of Skeletal Muscles in Ducks”的研究论文,该研究旨在研究鸭骨骼肌DNA甲基化的调控作用,采用WGBS和RNA-seq方法揭示了鸭骨骼肌DNA甲基化组和转录组图谱,通过DNA甲基化与基因表达的综合关联分析,筛选出与DNA甲基化相关的关键基因和信号通路,为探索DNA甲基化和鸭骨骼肌发育的潜在调控机制提供有价值的信息...