甲基化分析是一种用于检测和研究DNA、RNA和蛋白质甲基化的实验方法。蛋白质甲基化涉及将甲基基团添加到蛋白质的特定氨基酸残基上,通常是赖氨酸或精氨酸。这种修饰对蛋白质的功能、相互作用和定位有重要影响。以下是几种常用的蛋白质甲基化分析技术: 图1. 甲基化定量蛋白组学研究 ...
而对全面描述DNA甲基化模式的需求催生了多种针对其基因组分布的DNA甲基化分析技术,这些方法能够在基因组水平上从限制区域特定位点单碱基分辨率检测DNA甲基化。这篇综述讨论了主要基于DNA样本初始处理的不同DNA甲基化分析技术:重亚硫酸盐转化(bisulfite conversion),内切酶酶切技术(endonuclease digestion)和亲和富集(affinity...
近年来,科研人员开发出多种新型微流控芯片用于DNA甲基化分析并显示出明显优于传统方法的优势。 近期,来自天津大学精密测试技术及仪器全国重点实验室的研究人员在Nanotechnology and Precision Engineering期刊上发表题为“Advances in microfluidic-based DNA methylation analysis”的综述性文章,讨论了基于微流控技术的DNA甲基...
利用RRBS+oxRRBS鉴定牦牛和牛的大脑、脑干、小脑、下丘脑的基因组5mC和5hmC位点,绘制基因组DNA甲基化和羟甲基化图谱,并进行DNA甲基化/羟甲基化差异化分析和对应转录组的关联分析。 结论: 本研究利用RRBS+oxRRBS技术发现牦牛和牛的下丘脑和其他大脑区域的5mC和5hmC存在显著差异,鉴定出差异甲基化区域(DMR)和差异羟...
技术特点: ✴ 检测甲基化位点数500万~800万; ✴ 基于MspI限制性内切酶,target区域主要在甲基化岛; ✴ 单碱基分辨率; ✴ 成本低于WGBS。 3. 甲基化捕获测序 Agilent SureSelect甲基化捕获测序:Methyl-capture sequencing,实现对人、大小鼠目标区域甲基化捕获测序。
为助力低样本量多维度分析,易基因开发了富集覆盖CpG岛、启动子、增强子、CTCF结合位点的cfDNA甲基化测序方法——cfDNA-RBS,实现了高灵敏度和样本复用,使其具有高度可扩展性,并适用于有限的样本和单个细胞。 易基因建立的cfDNA-RBS技术,仅需10-15G测序数据,DNA建库起始量低至5ng的cfDNA样本,可以检测到的5X位点高达...
关于DNA甲基化测序:随着高通量测序技术的发展,我们能够从全基因组水平来分析5'-甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,发现很多基因组学研究发现不了的东西,这就是 "DNA甲基化测序"!且近年来测序成本的不断下降及测序技术的迭代更新,DNA甲基化测序方法可选择性更多了。
应用技术:WGBS、oxWGBS、RNA-seq 本研究选择从健康宫颈到CIN到宫颈癌(CC)的一系列样本,进行全基因组亚硫酸盐测序 (WGBS-seq)、oxWGBS-seq、RNA-seq 和组蛋白修饰数据进行综合分析,以确定CC特异性的潜在表观遗传生物标记物。 图:oxBS揭示宫颈癌发生过程中的DNA甲基化和羟甲基化水平变化[6] ...
属于早期的DNA 甲基化分析技术,其主要特征是只能分析基因组水平的5mC 比例,主要包括高效液相色谱、高效毛细管电泳、薄层层析、M.Sss I 甲基转移酶分析、去水乙缩氯醛反应、5mC 免疫学抗体技术等[2,3]。随着人类基因组计划的完成及HEP 的实施,单纯地判断基因组5mC 水平已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。2...
DNA甲基化检测技术的选择主要取决于研究需求和预算。以下是几种主要方法的优劣势分析：1. WGBS（全基因组亚硫酸盐后测序）：作为金标准，WGBS提供全基因组2800万甲基化位点的高分辨率检测，平均深度30X，但成本高、数据分析复杂，且适用于样本量较小的项目。单个样本数据量庞大，约100G。2. RRBS（全...