目的: 通过此教程,了解Discovery Studio中基于抗体序列构建抗体全长及Framwork区模型的操作方法及结果分析。所需功能和模块:Discovery Studio Client,DS Sequence Analysis,DS MODELER,DS Protein Families,DS Validate Protein Structure。所需数据文件:MA5_H.bsml、MA5_L.bsml 所需时间:1小时 介绍 抗体分子是...
Discovery Studio 官方教程(Help-Tutorials)创建3D QASR模型 采用能量格点作为描述符构建PLS模型(3D-QSAR)教程目的:通过此教程,了解并掌握Discovery Studio中构建三维定量构效关系模型的操作方法及结果分析。所需功能和模块:Discovery Studio Client,DS QSAR。所需数据文件:trainingset.sd,testset.sd。所需时… ...
在Discovery Studio(DS)中,可以直接构建分子结构,也可以将在其它画图软件中画好的结构直接拷贝到DS中,本教程演示如何在DS中构建小分子结构。1. 调用Sketching功能 从View菜单下,打开Toolbars,选择Sketching。Toolbars中将显示各种Sketching的工具,这些工具可以用来构建化合物的初始结构。2. 利用Sketching构建化合物...
目的: 通过此教程,了解Discovery Studio中构建组合化合物库并进行优化操作方法及结果分析。 所需功能和模块:Discovery Studio Client,DS Library Design。 所需数据文件:amines_35.sd,acids_45.sd和AmideFormation.rxn 所需时间:10分钟 代算| 专业服务,助您攻克科研难题,登顶科研巅峰!mp.weixin.qq.com/s/Szn...
使用Discovery Studio执行分子对接LibDock 分子对接是把配体分子放在受体活性位点位置,找到配体-蛋白之间有利的结合模式。Libdock分子对接速度快,但是精度低,常用于从小分子数据库里筛选出与蛋白活性位点匹配的小分子。Libdock得出的结合模式需由MD模拟或其他方法进一步验证合理性。此外,Libdock得到的配体-蛋白复合物可作为MD...
LibDock是Discovery Studio中的其中一种对接方法。该对接方法首先会针对受体活性位点计算得到热区图,该热区图包含极性和非极性部分;接着不同构象的配体分子分别刚性地叠合至热区图以形成比较合适的相互作用;然后进行能量优化;最后保留打分较高的对接构象。本教程将采用LibDock将一组配体分子对接到胸苷激酶(thymidine ...
32.6万 498 01:20:35 App Autodock Vina分子对接完整步骤 1.2万 0 13:11:26 App 分子模拟软件Discovery Studio(DS)详细视频教程合集 2.4万 5 04:16 App 【敲黑板】4.Discovery studio分子对接结果的可视化 5738 2 33:46 App Discovery Studio-轻松使用分子动力学模拟(1)信息...
目的: 通过此教程,了解Discovery Studio中虚拟氨基酸突变的操作方法及结果分析。所需功能和模块:Discovery Studio Client,DS CHARMm 所需数据文件:1aq1.pdb,2sta_I.pdb 所需时间:60分钟 介绍 蛋白的氨基酸定点突变可以用于酶与抗体的设计,但是由于进行氨基酸选择时的盲目性而导致效率低下。虚拟氨基酸突变可以...