AlphaFold2详解(一):武功总览,欲练此功...AlphaFold2详解(二):强大的外援,数据库搜索 AlphaFold...
AlphaFold 是单链蛋白预测的根本性突破。AlphaFold-Multimer 随后扩展到具有多个蛋白质链的复合物,随后是AlphaFold2.3,它提高了性能并将覆盖范围扩大到更大的复合物。2022 年,AlphaFold 与 EMBL 的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)合作,通过 AlphaFold 蛋白质结构数据库免费提供了几乎所有科学界已知的已编目蛋白质...
AlphaFold是DeepMind开发的一款蛋白质结构预测程序,可根据蛋白质的氨基酸序列预测其3D结构。AlphaFold主要有两个版本,分别于2018年和2020年推出。2021年,DeepMind在国际顶刊《自然》(Nature)上发表论文阐述了AlphaFold 2的细节,同时宣布正式开源AlphaFold 2模型代码。2022年7月,DeepMind宣布利用AlphaFold预测出超过100万...
Alphafold2的预测结果,与实验结果误差不超过一个原子。甚至很多时候人们觉得错的不是Alphafold,而是实验…...
1、RoseTTAFold1缺少侧链坐标的推断、AlphaFold2模块创新:如AlphaFold2中的triangular self-attention,...
YouTube0:00 - 导言3:10 - 蛋白14:20 - AlphaFold 1回顾18:20 - 几何模型优化25:40 - 矩阵31:20 - 蛋白序列对比39:40 - 矩阵输出43:45 - 猜测53:30 - 总结, 视频播放量 3596、弹幕量 0、点赞数 29、投硬币枚数 6、收藏人数 110、转发人数 25, 视频作者 塞琉西亚拆迁队, 作者
华盛顿大学医学院生物化学系教授、蛋白质设计研究所所长 David Baker教授领导的团队声称他们从AlphaFold2的设计思路中获得启发,构建了名为 RoseTTAFold 的人工智能软件系统。 “三轨” 神经网络 事实上,RoseTTAFold 是一个 “三轨” 神经网络("three-track" neural network),这意味着它能同时考虑一维蛋白质中的氨基酸...
开源链接:https://github.com/deepmind/alphafold 然而,有些研究者抱怨说数据文件太大了(2.2TB)。于是,在几个小时之内,一些敬业的研究者就创造出了一个 Google Colab notebook。借助这一工具,任何一个拥有免费谷歌账号的人都可以在自己感兴趣的蛋白质上运行略微简化的 AlphaFold 2,甚至不需要下载数据,也不...
人类基因组拥有超过20000种蛋白质的指令但目前能够确定的3d结构大约只有三分之一而alphafold神经网络生成了一个完全变革性的数据库该数据库包含来自智人和20种模型生物的5万多个结构目前已经预测了几乎整个人类蛋白质组的结构由生物体表达的蛋白质的全部补充 曾引起人工智能、生命科学两界大地震,DeepMind背后的AlphaFold2...
你可能从科学或常规媒体, 甚至可能是DeepMind自己的博客上听到过, 谷歌的AlphaFold 2无可争议地在第14届结构预测关键评估竞赛CASP14夺冠——该竞赛是为计算生物学家预测几种蛋白质结构的两年一次的盲测; 这些蛋白质的结构已经通过实验确定——但尚未公开发布. AlphaFold 2的预测结果准确得令人难以置信, 以至于很多人已...