conda create -n deepmd deepmd-kit=*=*cpu libdeepmd=*=*cpu lammps -c https://conda.deepmodeling.com -c defaults 我的电脑目前没有GPU,所以就先装了CPU版本 如果需要指定版本,只需要将上述指令的两个等号中间的*号改为版本号就行 例如要安装2.1.1版本,就是如下命令 conda create -n deepmd deepmd-ki...
DeePMD-kit v1.x 的描述子仅支持两体嵌入,虽然在环境矩阵中已经包括了构型多体相关性的的描述,但是这个描述仍然是不完备的。在绝大多数应用中这种不完备性不会导致模型精度不足,但我们仍然发现在少数极端情况下两体嵌入的深度势能模型无法满足用户需求,因此在DeePMD-kit v2.0.0中加入了三体嵌入,更加完备地描述每个...
DeePMD-kit(PaddlePaddle backend) Important 本项目为 DeePMD-kit 的 PaddlePaddle 版本,修改了部分代码,使其可以以 PaddlePaddle(GPU) 为后端进行训练、评估、模型导出、LAMMPS 推理等任务。案例支持情况如下所示。 exampleTrainTestExportLAMMPS water/se_e2_a✅✅✅✅ ...
需要先进入DeePMD环境:module avail查看可用软件列表(确定DeePMD-kit版本),module load anaconda3 进入python环境,conda activate deepmd-2.2.9-gpu 进入DeePMD-kit环境(这里要注意与module avail查看的名称一致,否则计算报错)。然后进行数据转换:在终端输入 python3 回车、import dpdata 回车、data=dpdata.LabeledSystem('...
DeePMD-kit的v2.0.0版本发布了重大升级,作为AI+分子模拟领域的领导者,新版本为开发者提供了更灵活的硬件支持和丰富的模型架构,同时,显著提升了训练和推断的效率。特别是DP模型压缩技术,对推断速度提升了一个数量级。本文将深入解析DP压缩训练,它进一步优化了模型训练效率,为用户使用DP带来了更流畅...
Deepmd-kit 是一款利用深度学习训练第一性原理数据得到势能模型的软件。其精致严谨的模型构造和高效自动的深度学习框架,使得产生的势能模型可以兼顾量子力学的精度和传统经验力场的效率。 - 飞桨AI Studio - 人工智能学习与实训社区
cd 到您选择的目录,并运行以下命令安装conda:一旦conda成功安装,打开.bashrc文件,并在其中添加如下环境变量(请将"sunny"替换为您的用户名):执行source命令以使环境变量生效,您可以通过运行以下命令测试conda的安装状态:如果返回了conda版本号,表示已成功安装conda,接下来可以进行DeepMD-kit的安装。
用户可以按照说明书安装Python接口和C++接口,手动安装DeePMD-KIT的难度相对较大。将DeePMD-KIT与LAMMPS、i-PI或GROMACS配合使用时,C++接口是必需的。有三种安装模式可以选择:离线安装、conda安装、docker安装。 一、conda安装 安装CPU版本的DeePMD-kit和LAMMPS: ...
DeePMD-kit 是围绕深度学习分子模拟方法DeepPotential开发的开源科学软件包。发布一年多以来,DeePMD-kit已被国内外多个研究组使用,涉及物理、化学、材料等多个领域。由于应用与开发需求的不断增加,我们决定定期开展使用交流会。在本次交流会上我们将发布和介绍DeePMD-kit v1.0版本和基于DeePMD-kit开发的力场生成软件DP-GE...
为了提升安装的稳定性,DeePMD-kit的安装模块进行了全面重构。依据PEP-517规范,构建自定义后端,确保在检测到未安装TensorFlow时,pip自动添加TensorFlow CPU版本作为构建依赖。同时,利用setuptools新特性,将setup.py中的元数据迁移到pyproject.toml。考虑到TensorFlow的C++库版本可能改变ABI,之前的轮子并未固定...