运行本教程需要安装deepmd-kit和dpdata deepmd-kit安装介绍:github.com/deepmodeling dpdata支持从vasp, lammps, deepmd, Amber, cp2k等软件读取输入数据,安装介绍可参考:github.com/deepmodeling 本篇教程的内容可以参考代码注释:github.com/deepmodeling import dpdata from deepmd.infer import DeepPot import numpy ...
通过pip一键安装Python接口，用户只需预先安装scikitbuild和cmake。调用dp h即可使用Python接口，简化了安装流程。解决PEP518的包隔离问题：开发者通过特殊技巧解决了TensorFlow的查找问题，进一步提升了安装的便利性。Conda的引入：利用Condabuild打包TensorFlow、DeePMDkit和LAMMPS，解决了C++接口的权限问题。用户只...
同时,开发者在主目录中添加了setup.py,调用scikit-build实现编译的自动化,并实现了自动搜索TensorFlow,从而使得用户能够用pip命令一键安装DeePMD-kit。 之后,开发者发现,一键安装DeePMD-kit的前提是提前装好scikit-build和cmake,这使得安装流程“不够一键”。这时,开发者发现了PEP-518,这一特性使得pip可以提前装好构建...
对于C++接口的安装，conda的引入解决了权限问题。开发者利用Conda-build打包TensorFlow、DeePMD-kit和LAMMPS，用户只需安装Anaconda或Miniconda后，通过简单的命令即可调用。社区还实现了GitHub上的自动编译和提交到conda-forge，清华大学开源软件镜像站的镜像服务使得国内用户也能方便获取。对于离线环境，开发者提供...
ATOMKIT 0.7.0版本发布。 VASPKIT 1.5.0测试版本发布 VASPKIT 1.5.0测试版本发布。 动态晶格畸变调控卤化物钙钛矿的载流子动力学 动态晶格畸变调控卤化物钙钛矿的载流子动力学。 4万元满配铂金三代64核心服务器 济南庚子矩阵云在2022年服务了全国200余个课题组,共部署 新知精选 新万店时代:鸡鸭成往事,茶咖是未来 以20...
conda create -n deepmd deepmd-kit=*=*cpu libdeepmd=*=*cpu lammps -c https://conda.deepmodeling.com -c defaults 我的电脑目前没有GPU,所以就先装了CPU版本 如果需要指定版本,只需要将上述指令的两个等号中间的*号改为版本号就行 例如要安装2.1.1版本,就是如下命令 ...
编辑input.json文件：这是DeePMDkit的配置文件，需要调整以下内容：原子类型编号：根据你的体系设置正确的原子类型编号。数据路径：指定转换后的数据的路径。训练参数：如”numb_steps”和”decay_steps”等，根据需要进行调整。执行模型训练：运行训练命令：根据DeePMDkit的文档或教程，...
幸运的是,DeePMD-kit 同时支持对 global label、atomic label 的拟合,也支持对多个 label 类型不同的体系同时拟合。类似于ener模式,我们需要提供coord.raw,type.raw,box.raw。此外,我们还需要根据拟合的 tensor 类型和该系统的 label 类型,提供dipole.raw或是atomic_dipole.raw(类似的,提供polarizability.raw或atomic...
DeePMD-kit支持CPU和GPU版本，根据个人需求选择。在终端运行相应命令安装。若需指定版本，替换命令中的*号为版本号。例如，要安装2.1.1版本，相应命令为：GPU版本：CPU版本：安装过程中，可能会遇到问题。为解决这类问题，推荐访问DeePMD-kit官方文档或使用conda-forge channel，执行特定命令以优化安装流程...
用户可以按照说明书安装Python接口和C++接口,手动安装DeePMD-KIT的难度相对较大。将DeePMD-KIT与LAMMPS、i-PI或GROMACS配合使用时,C++接口是必需的。有三种安装模式可以选择:离线安装、conda安装、docker安装。 一、conda安装 安装CPU版本的DeePMD-kit和LAMMPS: ...