DeePMD-kit(PaddlePaddle backend) Important 本项目为 DeePMD-kit 的 PaddlePaddle 版本,修改了部分代码,使其可以以 PaddlePaddle(GPU) 为后端进行训练、评估、模型导出、LAMMPS 推理等任务。案例支持情况如下所示。 exampleTrainTestExportLAMMPS water/se_e2_a✅✅✅✅ ...
点击跳转Bohrium 案例广场,参与知识共创. 关于DeePMD-kit DeePMD-kit 是一个深度学习包,基于神经网络拟合第一原理数据,用于多体势能表示和分子动力学。无需人工干预,即可在数小时内以端到端的方式将用户提供的数据转换为深度势能模型,并可与常用分子动力学模拟软件(LAMMPS、OpenMM、GROMACS等)无缝集成。DeePMD-kit可以...
condacreate -n deepmd deepmd-kit lammps -c conda-forge C接口离线包 在科学计算中,两个二进制程序传输数据,一般有三种做法:一是与其它进程用文件传输数据,这么做的效率无疑是很差的,可能出现的情景是少量调用,不在乎效率;二是与其它进程通信,例如用于并行的MPI,以及进程间通信的i-Pi和MDI;三是直接链接接口,...
5. **从头算分子动力学**:准确的从头算分子动力学(AIMD)模拟依赖于能量和力的首次原理计算,为水...
培训分为“DP 基础使用”、“DP 实战案例”、“DP 最新进展:DPA-2”三个部分。DP 基础使用主要给大家讲解 DP 系列软件的使用方法(主要是 DeePMD-kit 和 DP-GEN),DP 实战案例基于目前 DP 常见应用领域和学术成果,以理论+案例复现形式,向大家具体讲解 DP 的使用方式,让大家一步步变成 DP 深度用户;DP 最新...
DeePMD-kit 是围绕深度学习分子模拟方法DeepPotential开发的开源科学软件包。发布一年多以来,DeePMD-kit已被国内外多个研究组使用,涉及物理、化学、材料等多个领域。由于应用与开发需求的不断增加,我们决定定期开展使用交流会。在本次交流会上我们将发布和介绍DeePMD-kit v1.0版本和基于DeePMD-kit开发的力场生成软件DP-GE...
DeePMD-kit 是围绕深度学习分子模拟方法DeepPotential开发的开源科学软件包。发布一年多以来,DeePMD-kit已被国内外多个研究组使用,涉及物理、化学、材料等多个领域。由于应用与开发需求的不断增加,我们决定定期开展使用交流会。在本次交流会上我们将发布和介绍...
@曾晋哲总结了直接使用DeePMD-kit完成的工作:https://deepmodeling.com/blog/papers/deepmd-kit/和直接...
训练势函数主要使用DeepMD-kit,因此,本文主要介绍ubuntu系统下DeepMD-kit的安装。 DeepMD官网给出了三种安装方式:离线、conda、docker。 下面主要介绍使用conda安装DeepMD-kit。 首先,需要安装conda软件,如果已经安装conda,可以直接跳到第2步。 (1)conda安装
点击下方链接,跳转Bohrium 案例广场,参与知识共创: https://nb.bohrium.dp.tech 关于DeePMD-kit DeePMD-kit 是一个深度学习包,基于神经网络拟合第一原理数据,用于多体势能表示和分子动力学。无需人工干预,即可在数小时内以端到端的方式将用户提供的数据转换为深度势能模型,并可与常用分子动力学模拟软件(LAMMPS、Ope...