In addition to building up potential energy models, DeePMD-kit can also be used to build up coarse-grained models. In these models, the quantity that we want to parameterize is the free energy, or the coarse-grained potential, of the coarse-grained particles. See theDeePCG paperfor more de...
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX后面是指定安装位置,安装前注意安装位置,别安装到系统环境里面去了,不然后期升级DeePMD-kit的版本都不好升级。 make && make install make lammps 这时候目录下会有一个USER-DEEPMD,将这个文件夹cp到lammps的src目录下。 Lammps编译 cp /xx/lammps-29Aug2024/lib/gpu vim Makefile.mpi 如...
关于DeepMD-kit有很多资料可以学习。下面把自己参考的一些教程都列一下。 知乎: 深度势能Deep Potentialwww.zhihu.com/org/shen-du-shi-neng-deep-potential Github官网: https://www.baidu.com/link?url=8htR-4L8d2AP8QnfuMTaQZ977XQGCXOSNmQTgNF1ELr3RlHRYWq-c9pXkbKYlGQw6wINc-A0JBAf1wGanjbMKK&wd...
DeepMD官网给出了三种安装方式:离线、conda、docker。 下面主要介绍使用conda安装DeepMD-kit。 首先,需要安装conda软件,如果已经安装conda,可以直接跳到第2步。 (1)conda安装 conda发行版本有很多,常用的有anaconda,miniconda等。 以anaconda安装为例,先到官网或者到下面网址下载安装包: https://mirrors.tuna.tsinghua.e...
下面列举一些可能用得到的资源/网址：Github网站：GitHub - deepmodeling/deepmd-kit: A deep learning ...
docker pull ghcr.io/deepmodeling/deepmd-kit:1.3.1_cpu 四、使用与注意事项 dp和lmp分别为DeePMD-kit主程序与LAMMPS: dp -h lmp -h GPU版本已经包含CUDA,需要注意的是不同CUDA版本支持的NVIDIA驱动版本不同,详情可参见NVIDIA官网:https://docs.nvidia.com/deploy/cuda-compatibility/。
So, I using the Paddle SHA:e1e0deeto compile DeepMD-kit and LAMMPS , and I revised the code (to enable OneDNN)in the init function of paddle-deepmd/source/api_cc/src/PaddleDeepPot.cc. the pipeline of this softwares can compile smoothly. But the result of inference using LAMMPS is wrong...
DeepMD-kit的安装提供了离线、conda和docker三种方式供选择，本文将重点介绍使用conda安装DeepMD-kit的过程。在开始之前，确保您的Ubuntu系统已经安装了conda。如果没有，可以通过访问conda官网或使用以下命令下载并安装：cd 到您选择的目录，并运行以下命令安装conda：一旦conda成功安装，打开.bashrc文件，并在...
近日,我已经通过conda-build[1]构建了deepmd-kit(含lammps模块)的conda packges[2],并用constructor[3]打包了离线安装包。下介绍安装方法及注意事项: 一、conda安装 安装conda后,使用以下命令安装GPU版: conda install deepmd-kit=*=*gpu lammps-dp=*=*gpu -c deepmodeling ...
后来还是在DeePMD-kit官网上查到了解决办法,使用condo-forge channel就可以啦～ 输入图中所示命令就行 conda create -n deepmd deepmd-kit lammps -c conda-forge 之后就是等待安装,时间不快不慢吧。安装好之后,会出现以下界面 根据提示,输入以下命令,就可以激活环境了。环境激活后,命令行的(base)会变成(deepmd)...