文通其博士、Prof. David Srolovitz等人于2022年进行了DP在材料科学中的应用,深度势能DeepModeling:DP能...
DeepMD-kit软件在科研领域的应用颇为广泛,以化学科学为例,它在探索物质性质和结构方面展现出独特优势。一项研究中,DeepMD-kit结合AIMD技术,对TiO2-H2O界面进行了模拟,揭示了该界面在光催化水全解、UV诱导亲水性、TiO2生物活性等领域的关键作用。传统ab initio分子动力学技术在模拟固液界面时受到计算性能...
最近应用DeePMD-kit程序的文章连续发表在JACS上,总结如下: (1)J. Am. Chem. Soc.2022, 144, 23, 10524–10529 索邦大学Damien Laage课题组对该问题的研究。在深度势能(DP)的帮助下,研究者以硝酸和甲酸为例,比较了这两种酸在水溶液中的酸度,及空气-水界面上方和下方的酸度。构建酸与128个水分子的体系,用DFT...
最后,通过LAMMPS运行分子动力学模拟,实现模型在实际系统中的应用。此步骤包括调整LAMMPS输入文件以匹配冻结或压缩后的模型文件,并运行模拟以生成热力学信息和分子轨迹。观察log.lammps和ch4.dump文件,可以直观地验证模型预测结果的有效性。值得注意的是,在使用LAMMPS运行模拟时,可能遇到相关问题,例如找不...
一、背景 分子动力学仿真模拟在医药、化学、生物、材料等领域得到了广泛应用。它通过研究模拟物质的微观结构,帮助我们理解物质的宏观性质,甚至对物质的宏观性质进行预测。物质的微观结构是由原子间的相互作用决定的,因此分子动力学仿真模拟的关键在于如何建立模型来描述分子间的相互作用。传统的建模方法主要有...
DeePMD-kit 是一个用于多体势能表示和分子动力学的深度学习软件包,旨在在保持第一性原理计算精度的同时,提供分子动力学级别的计算效率。自2018年在GitHub开源以来,它已被数千名用户应用于各种研究,并在顶级学术期刊发表成果。为了帮助初学者更系统、全面地学习DeePMD-kit,深势科技算法团队携手Deep...
2022年1月5日,2022 ASC世界大学生超级计算机竞赛(ASC22)初赛正式开启。来自全球五大洲的300多支参赛队伍将在接下来的近两个月中,挑战“源”AI语言大模型、2020年戈登·贝尔奖获奖应用DeePMD-kit等尖端应用赛题。 报名参加ASC22的高校队伍中,不乏在上一个国际超算赛季表现突出的队伍,如ISC21和SC21冠军清华大学、AS...
14. **图形神经网络(GNNs)**:探索GNNs在模拟水和水溶液系统中的应用,以提高模拟的效率和准确性。
DP在金属钛和钛合金力学性质中的应用(一)Wen, T., Wang, R., Zhu, L., Zhang, L., Wang, ...
作者应用DeepMD-kit结合AIMD技术对TiO2-H2O界面进行模拟。TiO2-H2O界面在光催化水全解、UV诱导亲水性、...