deepmd的核心在于构建一个适合描述原子间相互作用的神经网络。通常采用的是多层感知机(Multi-Layer Perceptron,MLP)结构,该结构可以通过反向传播算法进行训练。 3.训练阶段 在这个阶段,使用数据准备阶段准备的训练数据集,通过反向传播算法不断调整神经网络的参数,使得神经网络可以准确地拟合原子间相互作用势能。这个过程需要...
DeepMD是一个用于分子动力学的深度学习模型,可以用来预测分子的动力学行为,包括分子内部的动力学、热力学以及反应机制等方面。 分子爆炸势函数,又称为爆炸函数或破裂函数,是用来描述分子内键断裂过程的势能函数。在DeepMD中,该函数被用于描述分子在发生化学反应时,内部化学键断裂和形成的过程。通过训练深度学习模型来拟合...
目前,NVNMD系统的训练代码已合并至DeePMD的GitHub账号,计算服务也已在微尺度科学计算云平台Bohrium®上线。用户可以点击下面2个链接,下载安装最新版DeePMD-kit,并参考帮助文档使用NVNMD的专属指令,训练得到深度势函数模型。最后,上传模型、输入脚本、体系初始构型至Bohrium®平台,来运行高速度、低价格、大容量、低功耗...
DeePMD-kit是一个开源软件包,用于利用神经网络势能进行分子动力学(MD)模拟。该软件包于2017年首次发布^{29} ,自那以后经历了快速发展,并得到了许多开发者的贡献。DeePMD-kit实现了一系列被称为深度势能(DP)模型的MLP模型^{9,10,51-54} ,已被广泛应用于物理学、化学、生物学和材料科学等领域,用于研究各种原子...
中国科学院院士鄂维南演讲:AI for Science 开启科研新范式,基于华为昇腾AI的DeePMD方法加速新能源材料的模拟。鄂维南院士表示,基于华为昇腾AI软硬件基础平台,通过物理模型+数据驱动+高性能计算的组合,DeePMD分子动力学模拟能够在保证精度的前提下,相对于传统分子动力
需要先进入DeePMD环境:module avail查看可用软件列表(确定DeePMD-kit版本),module load anaconda3 进入python环境,conda activate deepmd-2.2.9-gpu 进入DeePMD-kit环境(这里要注意与module avail查看的名称一致,否则计算报错)。然后进行数据转换:在终端输入 python3 回车、import dpdata 回车、data=dpdata.LabeledSystem(...
傅方佳:DeePMD用于研究锂硅负极脱嵌锂过程中的相变和结构演变, 视频播放量 950、弹幕量 0、点赞数 14、投硬币枚数 6、收藏人数 41、转发人数 9, 视频作者 DeepModeling, 作者简介 共同定义科学计算未来,相关视频:【教程】DP开发者亲授:一节课学透DeePMD-Kit原理,王一博
知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、
DeePMD-kit和DP-Gen安装啦啦黑还黑 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多1.2万 15 56:14 App DP-GEN machine.json输入文件配置 2.2万 72 18:54 App 化学家与能带结构 2万 35 40:08 App 【CP2K02】超详细CP2K编译全过程 7666 21 1:50 App 近期的视频打算,电催化, VASPsol, JDFTx, ...
DeePMD-kit团队在原有模型压缩的基础上，推出了Compressed Training功能。只需在训练指令中添加特定参数，即可利用预压缩的模型graph-compress.pb作为初始模型，大幅减少可学习参数，从而实现快速训练。压缩训练在某些情况下，比如小体系，可实现训练速度3倍以上的提升，减少了微调过程。Compressed Training分为...