DDA和DIA DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition）是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式，是最原始最简单的数据采集模式，在进行一级质谱分析后，根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析，可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄，在一定上可减少...
DIA和DDA是蛋白组学中两种进行二级质谱的数据采集模式,它们的主要区别如下: 采集方式:DDA(数据依赖采集模式)像机关枪扫描,是选择性的,它先采集一次一级质谱数据,再选择离子强度较强的肽段母离子进入二级质谱继续碎裂;而DIA(数据非依赖采集模式)则像轰炸机,覆盖范围广,无区别地将肽段母离子进行二级质谱碎裂,理论上能...
DDA和DIA DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。 DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄,在一定上可减少干扰...
DIA数据非依赖采集模式是DDA模式的延伸和发展,DIA主要通过高低碰撞能量进行一级质谱和碎片信息的交替采集,不需要对母离子进行筛选,利用若干个窗口对质谱进行全范围扫描,对每个窗口中的所有离子进行快速、循环选择和检测,理论上可以获得样本中所有离子的全部碎片信息,提高了数据利用度,缺失值更少,分析重复性更高,更适合于...
蛋白质组的DDA和DIA数据采集模式区分 前言 小伙伴们,大家好!在蛋白质组研究中,DDA(Data Dependent Acquisition,数据依赖采集)和DIA(Data-independent Acquisition,数据非依赖性采集)是质谱分析中两种不同的数据采集方法,它们在蛋白质组学和其他生物分析领域中有着不同的应用。可能大家会有点困惑,二者究竟有哪些区别呢...
DIA(data-independent acquisition)指数据非依赖型扫描模式,是基于静电场轨道阱Orbitrap一种全息式的质谱数据采集模式。DIA在一级质谱检测后,会对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子,从而进行蛋白的定性和定量。相对于DDA(数据依赖性的扫描模...
DIA（数据非依赖型扫描模式）与DDA（数据依赖性扫描模式）在蛋白质组学分析中扮演着重要角色。DIA基于静电场轨道阱Orbitrap，采用全息式质谱数据采集模式，它在一级质谱检测后，对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子，进行蛋白的...
DDA和DIA都被认为是自下而上蛋白质组学中基于发现的方法。这意味着在这两种情况下,蛋白质都被酶消化成更小的肽,并从肽中提取信息以推断蛋白质水平的结论。在DIA中,几乎所有肽段都被片段化在一起,然后使用质谱法进行分析。这种技术会产生复杂的碎裂 (MS2) 谱图,但会收集整个保留时间范围内所有肽的 MS2 数据。
DDA或IDA为数据依赖采集,DIA或SWATH为数据非依赖采集。 DDA和DIA.png 那如何区分呢? 以msdata包中的PestMix1数据集为例。它是同一个样品采用了两次不同的采集模式。 DDA模式 DIA模式 会发现: DIA数据的Isolation Windows为一定规律的等差数值组成的向量,而DDA数据采集完一级质谱后,二级质谱的质荷比貌似是随机的...
DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄,在一定上可减少干扰离子的存在,...