DDA和DIA DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition）是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式，是最原始最简单的数据采集模式，在进行一级质谱分析后，根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析，可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄，在一定上可减少...
DDA和DIA DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。 DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄,在一定上可减少干扰...
它是同一个样品采用了两次不同的采集模式。 DDA模式 DIA模式 会发现: DIA数据的Isolation Windows为一定规律的等差数值组成的向量,而DDA数据采集完一级质谱后,二级质谱的质荷比貌似是随机的,没有规律。 DIA数据基本上每个mz段内都要进行一次二级质谱的采集,相当于是进行了全扫,而DDA数据只有离子强度前几位会进行...
1. DDA更侧重于发现和鉴定,适合于探索性研究,可以发现新的或未知的化合物;而DIA更侧重于定量和验证,适合于大规模的生物标志物发现、蛋白质表达的定量分析以及需要高重复性和覆盖率的研究。 2. DDA可能错过低丰度的离子,而DIA提供了更全面的蛋白质组数据覆盖。 3. DDA数据处理相对简单,而DIA通常需要更复杂的数据...
DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法
DIA(data-independent acquisition)指数据非依赖型扫描模式,是基于静电场轨道阱Orbitrap一种全息式的质谱数据采集模式。DIA在一级质谱检测后,会对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子,从而进行蛋白的定性和定量。相对于DDA(数据依赖性的扫描模...
DDA和DIA都被认为是自下而上蛋白质组学中基于发现的方法。这意味着在这两种情况下,蛋白质都被酶消化成更小的肽,并从肽中提取信息以推断蛋白质水平的结论。在DIA中,几乎所有肽段都被片段化在一起,然后使用质谱法进行分析。这种技术会产生复杂的碎裂 (MS2) 谱图,但会收集整个保留时间范围内所有肽的 MS2 数据。
DIA（数据非依赖型扫描模式）与DDA（数据依赖性扫描模式）在蛋白质组学分析中扮演着重要角色。DIA基于静电场轨道阱Orbitrap，采用全息式质谱数据采集模式，它在一级质谱检测后，对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子，进行蛋白的...
DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄,在一定上可减少干扰离子的存在,...
DDA或IDA为数据依赖采集，DIA或SWATH为数据非依赖采集。那如何区分呢？dda数据的TargetMZ，即 featureData@data[["isolationWindowTargetMZ"]]的向量值都是不一样的，而DIA或SWATH数据@featureData@data[["isolationWindowTargetMZ"]]是固定的