DIA和DDA是蛋白组学中两种进行二级质谱的数据采集模式,它们的主要区别如下: 采集方式:DDA(数据依赖采集模式)像机关枪扫描,是选择性的,它先采集一次一级质谱数据,再选择离子强度较强的肽段母离子进入二级质谱继续碎裂;而DIA(数据非依赖采集模式)则像轰炸机,覆盖范围广,无区别地将肽段母离子进行二级质谱碎裂,理论上能...
DIA(data-independent acquisition)指数据非依赖型扫描模式,是基于静电场轨道阱Orbitrap一种全息式的质谱数据采集模式。DIA在一级质谱检测后,会对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子,从而进行蛋白的定性和定量。相对于DDA(数据依赖性的扫描模...
DIA提供了无与伦比的精密度和定量准确度、改进的可复制性以及比DDA更全面的肽采样。然而，DDA在库生成和数据库搜索方面具有优势，因为它具有接近肽特异性的MS2光谱，尤其在与深度分馏结合使用时。输入DIA肽段检索与选择“Blank Document”的区别在于，前者通过逐步完成表单来引导您完成操作，提供最大功能和...
DDA和DIA的区别 DDA或IDA为数据依赖采集,DIA或SWATH为数据非依赖采集。 DDA和DIA.png 那如何区分呢? 以msdata包中的PestMix1数据集为例。它是同一个样品采用了两次不同的采集模式。 DDA模式 DIA模式 会发现: DIA数据的Isolation Windows为一定规律的等差数值组成的向量,而DDA数据采集完一级质谱后,二级质谱的质...
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实验稳定度和重复度较高。 SILAC/Dimethyl 体内标记定量蛋白质组学 可对比23 个样品; 体内标记,标记稳定,组间误差小; 需要的样本量较小,仅需几十微克的蛋白。 SWATH DIA 全景蛋白质组学 全景式、高通量、非质谱依赖的数据采集手段; 数据采集精准高效,线性范围; 检测蛋白丰度跨越 4个数量级; 可分析多达 2000 ...
DDA和DIA都被认为是自下而上蛋白质组学中基于发现的方法。这意味着在这两种情况下,蛋白质都被酶消化成更小的肽,并从肽中提取信息以推断蛋白质水平的结论。在DIA中,几乎所有肽段都被片段化在一起,然后使用质谱法进行分析。这种技术会产生复杂的碎裂 (MS2) 谱图,但会收集整个保留时间范围内所有肽的 MS2 数据。
DDA或IDA为数据依赖采集，DIA或SWATH为数据非依赖采集。那如何区分呢？dda数据的TargetMZ，即 featureData@data[["isolationWindowTargetMZ"]]的向量值都是不一样的，而DIA或SWATH数据@featureData@data[["isolationWindowTargetMZ"]]是固定的
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