DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition）是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式，是最原始最简单的数据采集模式，在进行一级质谱分析后，根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析，可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄，在一定上可减少干扰离子的...
DIA数据非依赖采集模式是DDA模式的延伸和发展,DIA主要通过高低碰撞能量进行一级质谱和碎片信息的交替采集,不需要对母离子进行筛选,利用若干个窗口对质谱进行全范围扫描,对每个窗口中的所有离子进行快速、循环选择和检测,理论上可以获得样本中所有离子的全部碎片信息,提高了数据利用度,缺失值更少,分析重复性更高,更适合于...
它是同一个样品采用了两次不同的采集模式。 DDA模式 DIA模式 会发现: DIA数据的Isolation Windows为一定规律的等差数值组成的向量,而DDA数据采集完一级质谱后,二级质谱的质荷比貌似是随机的,没有规律。 DIA数据基本上每个mz段内都要进行一次二级质谱的采集,相当于是进行了全扫,而DDA数据只有离子强度前几位会进行...
DIA技术具有全景式扫描、数据可回溯等优势。相对于DDA,DIA模式的数据采集随机性更低,具有全景扫描、定量准确性高、数据利用度高等优势。新兴的4D-DIA蛋白质组学在3D蛋白质组学(保留时间、 质荷比、离子强度)基础上,增加了离子淌度这一维度,使结果更准确。DIA技术的这些创新特点使其被Nature Methods杂志在2015年评...
DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法
DDA与DIA模式都无需标记,对于样本类型均无限制,比较适用于多分组、大样本量的蛋白质组学分析。而DDA数据库相对成熟,容易鉴定,但是容易遗漏丰度较低的蛋白,批次间重复性差;DIA肽段全扫描,不遗漏,批次间重复性和稳定性高,但是数据处理复杂,成本比较高。
DDA与DIA采集的串联质谱图对比 左图:DDA由于采用了较窄的m/z窗口,得到的二级质谱图没有干扰离子影响(蓝色),并且与标准品的二级质谱图(红色)有很好的匹配; 右图:DIA由于在同一时间有较多离子与目标离子共流出,加之并未预先进行筛选,所有的离子都被碎裂,因此得到的串联质谱图(黑色)峰比较多,由于有其他母离子碎片...
与DIA相比,DDA模式下的质谱仪仅选择某些肽,然后将它们片段化,理想情况下一次一个。虽然DIA是定量目标的优越采集方法,但DDA是库生成和数据库搜索的首选方法,因为它具有接近肽特异性的MS2光谱。当与深度分馏结合使用时尤其如此。基于应用于现有蛋白质数据库的搜索引擎算法,DDA可以快速提供识别结果。
DIA（数据非依赖型扫描模式）与DDA（数据依赖性扫描模式）在蛋白质组学分析中扮演着重要角色。DIA基于静电场轨道阱Orbitrap，采用全息式质谱数据采集模式，它在一级质谱检测后，对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子，进行蛋白的...
DIA的谱图复杂度要远远高于DDA,因此在DIA方法开发的初期,数据分析基本上依赖于谱图库搜索(Spectral library)的方法,即要事先通过多组份分馏的方法将所有待分析样本的混合物进行高pH液相色谱分离,然后通过DDA的采集方法获得建库数据,使用建库数据的鉴定结果作为谱图库,然后进行DIA数据的定性和定量分析。谱图库搜索速度快...