DDA(Data Dependent Acquisition)和DIA(Data Independent Acquisition)是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式,是最原始最简单的数据采集模式,在进行一级质谱分析后,根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析,可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄,在一定上可减少干扰离子的...
DIA和DDA是蛋白组学中两种进行二级质谱的数据采集模式,它们的主要区别如下: 采集方式:DDA(数据依赖采集模式)像机关枪扫描,是选择性的,它先采集一次一级质谱数据,再选择离子强度较强的肽段母离子进入二级质谱继续碎裂;而DIA(数据非依赖采集模式)则像轰炸机,覆盖范围广,无区别地将肽段母离子进行二级质谱碎裂,理论上能...
DIA数据非依赖采集模式是DDA模式的延伸和发展,DIA主要通过高低碰撞能量进行一级质谱和碎片信息的交替采集,不需要对母离子进行筛选,利用若干个窗口对质谱进行全范围扫描,对每个窗口中的所有离子进行快速、循环选择和检测,理论上可以获得样本中所有离子的全部碎片信息,提高了数据利用度,缺失值更少,分析重复性更高,更适合于...
🔍 DDA:选择性数据采集 DDA模式可以想象成是一种“机关枪式”的扫描方式,它会在每个扫描周期中选择最强的离子进行二级质谱分析。这种方法的优点是处理速度快,但缺点是可能会漏掉一些强度较低但同样重要的离子。💣 DIA:全扫描数据采集 相比之下,DIA模式更像是一种“轰炸机式”的扫描方式,它会对所有离子进行全扫...
DIA(data-independent acquisition)指数据非依赖型扫描模式,是基于静电场轨道阱Orbitrap一种全息式的质谱数据采集模式。DIA在一级质谱检测后,会对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子,从而进行蛋白的定性和定量。相对于DDA(数据依赖性的扫描模...
DDA与DIA模式都无需标记,对于样本类型均无限制,比较适用于多分组、大样本量的蛋白质组学分析。而DDA数据库相对成熟,容易鉴定,但是容易遗漏丰度较低的蛋白,批次间重复性差;DIA肽段全扫描,不遗漏,批次间重复性和稳定性高,但是数据处理复杂,成本比较高。
DIA(数据非依赖型扫描模式)与DDA(数据依赖性扫描模式)在蛋白质组学分析中扮演着重要角色。DIA基于静电场轨道阱Orbitrap,采用全息式质谱数据采集模式,它在一级质谱检测后,对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子,进行蛋白的...
DIA与DDA鉴定结果的比较 方法:对一个尿液样本进行DDA和DIA检测,分别各三次技术重复。 比较结果: (1)肽段和蛋白的鉴定数目:DIA比DDA鉴定出多一倍的肽段和蛋白数目(蛋白数目DIA:1301,DDA:638),因此缺失值大大减少(图3)。 图3 DIA与DDA鉴定肽段和蛋白数目的比较 ...
DDA 1 之前已经提到,DDA可以同时获得被测代谢物的一级质谱和碎片信息,母离子的筛选主要依靠研究者预先设定的条件,如信噪比,同位素分布,离子强度,选择top-n等等。该方法由于采用了较窄的m/z(通常为~1Da)窗口进行筛选目标离子减少了干扰离子的存在,因此可以为研究者提供较高质量的碎片信息。