DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition）是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式，是最原始最简单的数据采集模式，在进行一级质谱分析后，根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析，可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄，在一定上可减少干扰离子的...
DIA数据非依赖采集模式是DDA模式的延伸和发展,DIA主要通过高低碰撞能量进行一级质谱和碎片信息的交替采集,不需要对母离子进行筛选,利用若干个窗口对质谱进行全范围扫描,对每个窗口中的所有离子进行快速、循环选择和检测,理论上可以获得样本中所有离子的全部碎片信息,提高了数据利用度,缺失值更少,分析重复性更高,更适合于...
DIA技术具有全景式扫描、数据可回溯等优势。相对于DDA,DIA模式的数据采集随机性更低,具有全景扫描、定量准确性高、数据利用度高等优势。新兴的4D-DIA蛋白质组学在3D蛋白质组学(保留时间、 质荷比、离子强度)基础上,增加了离子淌度这一维度,使结果更准确。DIA技术的这些创新特点使其被Nature Methods杂志在2015年评...
DIA数据非依赖采集模式是DDA模式的延伸和发展,DIA主要通过高低碰撞能量进行一级质谱和碎片信息的交替采集,不需要对母离子进行筛选,利用若干个窗口对质谱进行全范围扫描,对每个窗口中的所有离子进行快速、循环选择和检测,理论上可以获得样本中所有离子的全部碎片信息,提高了数据利用度,缺失值更少,分析重复性更高,更适合于...
DIA(data-independent acquisition)指数据非依赖型扫描模式,是基于静电场轨道阱Orbitrap一种全息式的质谱数据采集模式。DIA在一级质谱检测后,会对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子,从而进行蛋白的定性和定量。相对于DDA(数据依赖性的扫描模...
DIA（数据非依赖型扫描模式）与DDA（数据依赖性扫描模式）在蛋白质组学分析中扮演着重要角色。DIA基于静电场轨道阱Orbitrap，采用全息式质谱数据采集模式，它在一级质谱检测后，对特定质荷比范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，快速依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子，进行蛋白的...
DDA 1 之前已经提到,DDA可以同时获得被测代谢物的一级质谱和碎片信息,母离子的筛选主要依靠研究者预先设定的条件,如信噪比,同位素分布,离子强度,选择top-n等等。该方法由于采用了较窄的m/z(通常为~1Da)窗口进行筛选目标离子减少了干扰离子的存在,因此可以为研究者提供较高质量的碎片信息。
全扫描模式通过将代谢物一级和二级分开扫描，但所需时间较长。数据依赖采集(DDA)模式中，质谱仪器先进行全扫描，然后对从全扫描质谱中选择的母离子（强度依赖）列表进行二级扫描。DIA模式理论上能连续无偏倚地采集所有代谢物的MS2信息，但其数据处理存在挑战，因MS2质谱信息复杂且母离子和子离子关联不紧密...
DIA的谱图复杂度要远远高于DDA,因此在DIA方法开发的初期,数据分析基本上依赖于谱图库搜索(Spectral library)的方法,即要事先通过多组份分馏的方法将所有待分析样本的混合物进行高pH液相色谱分离,然后通过DDA的采集方法获得建库数据,使用建库数据的鉴定结果作为谱图库,然后进行DIA数据的定性和定量分析。谱图库搜索速度快...
与DIA相比,DDA模式下的质谱仪仅选择某些肽,然后将它们片段化,理想情况下一次一个。虽然DIA是定量目标的优越采集方法,但DDA是库生成和数据库搜索的首选方法,因为它具有接近肽特异性的MS2光谱。当与深度分馏结合使用时尤其如此。基于应用于现有蛋白质数据库的搜索引擎算法,DDA可以快速提供识别结果。