Cut&Tag是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,相较于传统的ChIP-Seq具有以下优点:所需细胞量少,背景信号低,可重复性好,无需ChIP级别抗体等优点,甚至可用于单细胞水平测序。Cut&Tag技术可从基因组范围内检测组蛋白、RNA polymerase II和转录因子等蛋白质结合的DNA区端,应用于临床和科研的表观遗传学研究,或是结合生物信息学分析,找到转录因子下游调控的靶基...
是CUT&RUN的2.0版本。CUT&Tag完全颠覆传统ChIP-seq（染色质免疫沉淀-测序）的操作流程，它能够高效、...
CUT&Tag的核心原理是利用抗体识别目标蛋白或特定的染色质修饰标记，并通过蛋白酶Tn5转座酶（Tagmentase）在目标位点上进行高效的DNA片段化和文库构建。Stephen Henikoff团队于2019年研发了CUT&Tag，作为ChIP-Seq（免疫共沉淀测序）的改进和替代方法。CUT&Tag技术凭借其高灵敏度、低背景噪音和低细胞量需求，已成为揭示基~...
CUT&Tag技术的诞生无疑给了ChIP实验人一剂强心针。作为一种新的DNA-蛋白质互作技术,与传统的ChIP-Seq技术有着根本不同,以其实验周期短(<10小时)、步骤简单(无需超声破碎和免疫共沉淀)、细胞起始量低(10万以下,乃至单细胞)、重复性好、信噪比高等...
图1. ChIP 与 CUT&Tag 的比较 少细胞高兼容——CUT&Tag CUT&Tag 技术的核心是在 Tn5 上融合了 protein AG 抗体结合功能域的转座体 pAG-Tn5。Tn5 可以包埋建库接头序列,具有「剪切 + 粘贴」的特性,在建库实验中大放异彩。可以在切割目的位点的同时,在目的片段两端添加建库接头,大大简化了建库流程,并且可兼容...
尽管CUT&Tag与ChIP方法在某些方面类似，但CUT&Tag实验的起始材料是活的可渗透细胞或分离的细胞核，而不是ChIP-seq中使用的甲醛交联的细胞或组织。CUT&Tag有望将蛋白与染色质DNA互作的研究变成了一种类似PCR反应的常规操作，对基因调控、表观遗传等领域的研究具有重要的意义。表 CUT&Tag与ChIP-seq比较 服务流程 服...
CUT&Tag-qPCR方案目前做CUT&Tag-qPCR时，有两种，一种是蛋白酶K消化和gDNA提取后直接qPCR实验，一种是完成建库后进行qPCR。这两种方式都有文献可参考。目前翌圣更推荐完成建库后进行qPCR实验。qPCR 定量检测 qPCR试剂以翌圣的Hieff UNICON® Universal Blue qPCR SYBR Green Master Mix（Cat#11184）为例。反应体系...
研究者们做了棉花材料的表观测序,主要是比较最新的技术 cleavage under targets and tagmentation (CUT&Tag)和以前的 chromatin immunoprecipitation with sequencing (ChIP-seq) 技术,结论是 CUT&Tag技术实验流程更快,对peaks的分辨率更高,而且背景噪音更小。
华银康集团高通量测序检测中心CUT&Tag测序在整个实验过程中无需甲醛交联、超声打断、末端修复和连接接头等操作,通过对细胞预处理、免疫共沉淀、文库构建等关键过程进行技术改进,对ChIP-Seq技术进行全面革新,成为DPI研究的最佳选择[1]。 与传统ChIP-Seq工作流程比较 [1]...
1、ChIP-seq、CUT-Tag、DAP-seq ChIP-seq、CUT-Tag、DAP-seq都是利用高通量测序技术去获得转录因子与DNA互作的信息。 (1)ChIP-seq ChIP-seq其实就是染色质免疫共沉淀,结合二代测序的过程。最初被用于组蛋白修饰的研究,后被广泛应用于转录因子与启动子结合的研究。染色质免疫沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP...