CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是替换传统的ChIP-Seq来研究蛋白质-DNA互作的新技术。与ChIP相同的是都需要利用抗体识别并结合目标蛋白，不同点在于CUT&Tag技术利用Tn5转座酶与Protein A/G的融合蛋白，把酶引导至与目标染色质结合的抗体。Tn5转座酶预先加上adapter，形成组装的pA/G-Tn5转座体，Tn...
CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作新兴的实验方法,该方法是通过蛋白特异性抗体引导Protein A-Tn5酶在目标蛋白结合的DNA位置进行切割,并且在序列两端加上测序接头,经过PCR扩增后形成可用于高通量测序的文库,随后对文库进行测序分析从而解析与目标蛋白结合的DNA片段。
CUT&Tag目前的价格比较稳定,如果你有数据分析能力,即可自己购买试剂盒建库,再交由测序公司进行扩增测序,自己再对原始数据进行分析,将会剩下一大笔费用。 CUT-Tag下机数据处理 1.下机数据 CUT-Tag本质上是对转录因子所下拉得DNA序列进行二代测序,因此下机数据和转录组的所类似为fsatq序列。 下机数据 2.质量控制 ...
CUT&Tag技术的核心是将Tn5转座酶进行改造,融合proteinA/G(形成pA/G-Tn5融合蛋白),其优点是特异性强,灵敏度高,背景噪音较低,重复性好,并且对样本要求量少。现在,CUT&Tag已成为组蛋白翻译后修饰(PTM)和从包括单细胞在内的少数细胞中选择转录因子的强大分析技术。 在CUT&Tag实验过程中如何保证实验的成功率呢?爱基...
CUT&Tag技术的核心是将Tn5转座酶进行改造,融合proteinA/G(形成pA/G-Tn5融合蛋白),其优点是特异性强,灵敏度高,背景噪音较低,重复性好,并且对样本要求量少。现在,CUT&Tag已成为组蛋白翻译后修饰(PTM)和从包括单细胞在内的少数细胞中选择转录因子的强大分析技术。
图1.CUT&Tag技术工作原理图 应用场景一: CUT&Tag技术分析手段——高通量测序(NGS)或qPCR 从作用原理上看,CUT&Tag技术本身属于高通量测序(NGS)系列。CUT&Tag试剂盒本身是一种建库试剂盒,适用于二代测序。这是因为,CUT&Tag技术包含了ChIP实验靶蛋白结合片段的获取和文库构建两部分实验。从客户文章来看,近岸蛋白质...
CUT&Tag相较于ChIP-seq具有更低的背景信号 相较于ChIP-seq,CUT&Tag具有更高的样本重复性 在相同的测序数据量下,CUT&Tag的peak Region内的数据量更多,信号更强 承启生物CUT&Tag分析流程 部分CUT&Tag分析内容展示 reads相对基因位置分布统计 基因功能区peak分布占比图 ...
图1.CUT&Tag技术工作原理图 应用场景一: CUT&Tag技术分析手段——高通量测序(NGS)或qPCR 从作用原理上看,CUT&Tag技术本身属于高通量测序(NGS)系列。CUT&Tag试剂盒本身是一种建库试剂盒,适用于二代测序。这是因为,CUT&Tag技术包含了ChIP实验靶蛋白结合片段的获取和...
CUT&Tag本身是结合高通量测序的一类技术,所获取的实验结果也是测序文库。CUT&Tag的文库与ChIP-Seq类似,都是200-1000bp大小的文库。测序所得的数据可以用常规的分析软件进行分析。一般的实验流程为:细胞与磁珠结合—一抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片...
CUT&Tag 试剂为您提供高质量数据 一、组蛋白修饰分析 1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对HCT 116细胞进行CUT&Tag实验。 2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对低细胞数量的NCCIT细胞进行CUT&Tag实验。