我们的CUT&Tag分析依托先进的Protein A/G-Tn5融合蛋白体系和高通量测序平台，专注于解析蛋白质-DNA互作，特别是转录因子结合位点和组蛋白修饰的全基~因组分布。我们的检测涵盖从样本制备、测序到数据分析的全流程支持，提供全面的基~因组注释、功能分析和信号通路解析，帮助您精准揭示基~因调控网络，为表观遗传学、...
值得注意的是,CUT&Tag分析表明,转录起始位点(TSS)上的组蛋白H3K9la需要HBO1。此外,受调控的Kla可促进关键信号通路和肿瘤发生,通过评估HBO1-敲除(KO)肿瘤细胞的恶性行为以及临床组织中组蛋白H3K9la的水平进一步支持了这一点。此研究表明HBO1作为一种乳酸转移酶介导组蛋白kla依赖的基因转录。 对Hela和HBO1-KO细胞的K...
表1 CUT&Tag与ChIP-seq实验相比具有的优势 CUT&Tag在植物上的应用 2019年Kaya-Okur等人首先在哺乳动物中使用CUT&Tag技术提供了高分辨率测序来分析不同的染色质组分,通过在低样本量和单细胞水平分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子的表达证明了CUT&Tag技术的实用性 (Kaya-Okur et al., 2019)。这是首次运用CUT...
CUT&Tag在文库构建上更加容易操作,并且相比于CUT&RUN,CUT&Tag有更好的重复性,更低规模的细胞数量下限。 接下来我将介绍cut&tag数据上游分析流程 首先拿到公司测序得到的fastq文件(Raw Data),上传到服务器的特定文件夹中,例如/home/zyn/cut&tag/fastq 质控 cd/home/zyn/#注意mkdir -p ./cut&tag/fastq报错,是...
CUT&Tag本身是一种高通量测序技术,zui终所获取的实验结果也是测序文库。CUT&Tag的文库与ChIP-Seq类似,都是200-1000bp左右的文库。测序所得的数据可以用常规的分析软件进行分析,无需特殊的分析软件。一般的实验流程为:细胞与磁珠结合—一抗孵育—二抗孵育—转座体孵育—片段化—DNA提取—PCR构建文库—文库纯化—质检...
CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作新兴的实验方法,该方法是通过蛋白特异性抗体引导Protein A-Tn5酶在目标蛋白结合的DNA位置进行切割,并且在序列两端加上测序接头,经过PCR扩增后形成可用于高通量测序的文库,随后对文库进行测序分析从而解析与目标蛋白结合的DNA片段。 CUT&Tag技术原理 02 实验流程 CUT&Tag实验流程较为简便,首先...
CUT&Tag技术利用一抗靶向结合目的蛋白,二抗孵育放大信号,创新性地使用pAG-Tn5融合蛋白与一抗和二抗结合,在Mg2+条件下精准切割目标区域并进行建库测序分析,实现对DNA-蛋白质互作的捕获和验证。 相比于ChIP技术来说,CUT&Tag技术凭借原位捕获DNA与蛋白质互作的特点,建库更...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),即靶向剪切及转座酶技术,是一种利用酶锚定技术进行高效、高分辨率的DNA测序文库构建方法,同时是一种新的DNA-蛋白质互作研究方法,可用于检测组蛋白、RNApolymeraseII和转录因子等具有DNA结合功能的蛋白种类,揭示更多染色质在调控基因表达方面的重要作用,有助于分析细胞量...
CUT&Tag 是新出现的研究特定蛋白质与染色质 DNA 相互作用的新技术,用这种技术得到的海量数据,需要经过生物信息学分析,变成大量的图和表,以方便科学家进行研究。 本视频详细解读 CUT&Tag 标准分析报告中的各种图表,让 CUT&Tag 的用户可以更好地理解报告的内容,并更容易地发掘出报告中有用的信息。 视频字幕内容 ...
CUT&Tag在植物上的应用 2019年Kaya-Okur等人首先在哺乳动物中使用CUT&Tag技术提供了高分辨率测序来分析不同的染色质组分,通过在低样本量和单细胞水平分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子的表达证明了CUT&Tag技术的实用性 (Kaya-Okur et al., 2019)。这是首次运用CUT&Tag技术进行动物细胞组蛋白修饰及转录因子结...