如何使用csr_matrix初始化gensim语料库变量? 、、、 我将X作为一个csr_matrix,它是我使用scikit的tfidf向量器获得的,y是一个数组。我的计划是使用LDA创建特性,但是,我没有找到如何用X作为csr_matrix初始化gensim的语料库变量。换句话说,我不想像gensim文档中所示的那样下载一个语料库,也不想将X转换成一个密集的...
csr_matrix-data_id : int-indices_id : int-indptr_id : int+store_matrix() : void+read_matrix() : csr_matrix 在这个类图中,csr_matrix类表示了一个csr_matrix对象,包含了data_id、indices_id和indptr_id等属性,以及store_matrix()和read_matrix()等方法。 关系图 下面是一个简单的关系图,用来表示...
稀疏csr_matrix是一种常见的稀疏矩阵存储格式,它以压缩行存储的方式表示矩阵,适用于存储大规模稀疏矩阵。稀疏矩阵是指矩阵中绝大多数元素为0的矩阵,相对于密集矩阵,稀疏矩阵在存储和计算上具有更高的效率。 将阈值函数应用于稀疏csr_matrix可以实现对矩阵中元素的筛选和过滤。具体而言,可以通过设定阈值来将矩...
一、根据坐标col,以及值进行表示生成矩阵。 代码 >>> row=np.array([0,0,1,2,2,2]) >>> col=np.array([0,2,2,0,1,2]) >>> data=np.array([1,2,3,4,5,6]) >>>csr_matrix((data,(row,col)),shape=(3,3)).toarray() array([[1, 0, 2], [0, 0, 3], [4, 5, 6]])...
>>> csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(3, 3)).toarray() array([[1, 0, 2], [0, 0, 3], [4, 5, 6]]) #按row行来压缩 # 对于第i行,非0数据列是indices[indptr[i]:indptr[i+1]] 数据是data[indptr[i]:indptr[i+1]] ...
参考:scipy.sparse.csr_matrix — SciPy v1.8.0 Manual CSR Matrix的存储结构包含三列数据: Index Pointers:表示数据索引的偏置,该列表中每个元素表示“当前行最后一个数据的索引”相对“上一行行最后一个数据的索引”的偏移量(差值) Indices:列表中每个元素对应一个数据的列索引 ...
csr_matrix函数主要是用来压缩稀疏矩阵。 一、csr_matrix函数 from scipy.sparse import csr_matriximport numpy as np# data:代表的是稀疏矩阵中存储的所有元素data = np.array([1,2,3,4,5,6])# indices: 代表的是这6个元素所在的列的位置indices = np.array([0,2,2,0,1,2])# indptr: 游标,每一...
csr_matrix((data, indices, indptr), [shape=(M, N)]) is the standard CSR representation where the column indices for row i are stored in indices[indptr[i]:indptr[i+1]] and their corresponding values are stored in data[indptr[i]:indptr[i+1]]. If the shape parameter is not supplied...
4.标量乘法:将一个CSR矩阵的所有元素乘以一个标量得到一个新的CSR矩阵。 5.矩阵转置:将CSR矩阵的行和列交换得到一个新的CSR矩阵。 可以使用scipy库中的csr_matrix函数来创建CSR矩阵,并使用相应的运算符来执行这些运算。例如: ```python import numpy as np from scipy.sparse import csr_matrix #创建CSR矩阵 ...
data.X=scipy.sparse.csr_matrix(data.X) 这里再复习一下Anndata中的csr_matrix格式 anndata AnnData 格式通常包含以下slot: X包含表达式矩阵。 obsm包含嵌入数据。 obs包含细胞元数据。 var包含基因元数据。 image.png It is recommended to store the expression matrix in CSR (compressed sparse row) format to...