##conda install -y sra-tools=2.10.7 ##安装完成返回3个done,如果有一个文件比较大,终止了,可以重新运行安装命令 # aspera conda install -y aspera-cli -c hcc ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install -y trim-galore hisat2 subread multiqc samtools salmon fastp ##作为新手,建...
如果有一个文件比较大,终止了,可以重新运行安装命令 # aspera conda install -y aspera-cli -c hcc ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install -y trim-galore hisat2 subread multiqc samtools salmon fastp ##作为新手,建议一个个软件安装,有时候软件之间会出现冲突,conda不能解决软件之间的...
conda install-y aspera-cli-c hcc##-c hcc,-c是指定它在hcc频道,就是指定安装的频道##调用帮助文档,不是软件的名字,如下ascp--help#有时候一个软件是一个工具集,它下面有很多工具,每个工具都有不同的名字,就调某个具体工具的名字,而不是调用软件的名字。#samtools,fastqc刚好有一个软件名和它的命令是一...
conda install -y samtools=1.14 # aspera conda install -y -c hcc aspera-cli ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install -y python=3.7 libstdcxx-ng=9.1.0 trim-galore cutadapt=4 hisat2 subread multiqc samtools=1.16.1 salmon=1.4.0 fastp fastqc # mamba install -y python=3.7 libstdcxx...
conda install tensorflow-gpu=1.12 cudatoolkit 这种方式下，每个虚拟环境需要单独安装它所对应的cuda以及...
conda install-c bioconda samtools openssl=1.0 可是最近由于清华源的镜像用不了了,所以以上方法行不通。 所以旧的换个方法了,查看一下运行trinity调用脚本align_and_estimate_abundance.pl进行表达量估计的时候的报错: samtools:errorwhileloading shared libraries:libcrypto.so.1.0.0:cannotopensharedobjectfile:No su...
Shell是一种命令行解释器,常用于执行系统命令和脚本。Conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,主要用于安装、配置和管理软件包及其依赖关系。 Snakemake是一个用于构建和运行可重复...
bioconductor-rsamtools bioconductor-rtracklayer bioconductor-s4arrays bioconductor-s4vectors bioconductor-scran bioconductor-scuttle bioconductor-seqarray bioconductor-snpstats bioconductor-sparsearray bioconductor-sparsematrixstats bioconductor-sva ...
bioconductor-rsamtools bioconductor-rtracklayer bioconductor-s4arrays bioconductor-s4vectors bioconductor-scran bioconductor-scuttle bioconductor-seqarray bioconductor-snpstats bioconductor-sparsearray bioconductor-sparsematrixstats bioconductor-sva bioconductor-tfbstools bioconductor-tiledbarray bioconduc...
conda install tensorflow-gpu=1.12 cudatoolkit 这种方式下，每个虚拟环境需要单独安装它所对应的cuda以及...