conda install blastplus 注意:由于BLAST版本和相关的conda包会随时间变化,请根据你搜索到的具体包名进行调整。 验证BLAST是否成功安装: 安装完成后,你可以通过在命令行中输入BLAST程序的名称(如blastn、blastp等)并加上--version参数来验证其是否成功安装并可在你的系统路径中找到。例如: bash blastn --version...
conda activate rnaseq # 启动小环境 conda deactivate #退出小环境 conda env list / conda info --env #查看共有多少个小环境 conda remove -n python --all #删除conda小环境 软件安装 可以直接使用conda去安装一些我们需要用到的软件,比如我之后要搭建的blast 搜索哪些软件可以用conda下载 网站查询 https://...
BLAST包括blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等。 输入conda install blast安装blast。 输入blastn/blastp/blastx/tblastn/tblastx -h查看是否完成安装及使用方法。 安装mafft 多序列比对在生物信息分析中是常用到的操作,目前多序列比对的软件较多,没有一款十分完美的多序列比对工具。有文献报道: 在比对速度上...
#安装指定的软件包conda install {package_name}#安装指定源的软件包conda install -c urls lib_name#在指定位置创建安装包## 格式:conda install [-n 环境名称 | -p path] [-c channel_address] [PackageName]## -n, --name:安装PackageName包的环境名称。## -p:也可以不指定环境名称,指定环境的绝对路...
conda create -y -n R4 python=3.8 # 激活R4环境 conda activate R4 # (可选步骤:在R4里安装mamba) # conda install mamba # 安装R语言本体 conda install -y r-base=4.2 ## 或者使用mamba安装:mamba install -y r-base=4.1.2 # 安装R语言软件包(安装命令可从Linux软件安装.md文件中查找)安装时间较...
因为要使用本地blast 我从conda安装,命令如下: conda install -c bioconda blast ##安装过程如下: Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: done ==> WARNING: A newer version of conda exists. <== current version: 4.8.4 ...
因为要使用本地blast 我从conda安装，命令如下：conda install -c bioconda blast 安装过程如下：Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: done ==> WARNING: A newer version of conda exists. <== current version: 4.8.4 latest version:...
ncbi.nlm.nih.gov/blast/db #这里密码是空的，我们直接敲回车即可 #ls 列出文件 >ls >cd /blast/...
conda install docker 安装Python依赖项。您需要运行以下命令来安装所需的Python包: pip install numpy grpcio-tools biopython requests absl-py opencv-python pyyaml matplotlib 下载Alphafold2的Docker镜像。您可以从AlphaFold2的GitHub存储库中找到最新的Docker镜像(https://github.com/deepmind/alphafold)。克隆存储库并...
blast是一个软件包 运行: blastp、blastq等 环境管理(运行一个有多个环境的软件,隔离指定版本) conda create -n py27 conda activate [环境名称],默认的主环境是base conda enc list conda deactivate mamba当安装软件多时候,可以加速安装处理 conda install mamba ...