RNA Immunoprecipitation Sequencing (RIP-seq) 技术简介 RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉淀结合高通量测序的一种技术,通过免疫沉淀靶蛋白来捕获互作的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序,有助于了解转录后调控网络的动态过程。 技术优势 1. RNA-seq不仅局限于miRNA与RNA结合蛋白(RBP)的传统研究,...
RNA Immunoprecipitation Sequencing (RIP-seq) 技术简介 RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉淀结合高通量测序的一种技术,通过免疫沉淀靶蛋白来捕获互作的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序,有助于了解转录后调控网络的动态过程。 技术优势 1. RNA-seq不仅局限于miRNA与RNA结合蛋白(RBP)的传统研究,...
CLIP-seq,也称为HITS-CLIP,是一种在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其主要原理是利用紫外照射使RNA分子与RNA结合蛋白发生耦联,然后使用特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀,回收其中的RNA片段。经过添加接头、RT-PCR等步骤进行高通量测序,再通过生物信息学的分析和处理,揭示RNA结合蛋白与RNA...
CLIP-seq结合了实验和测序方法,可以研究某种蛋白质在体内的RNA的结合情况。原理为基于RNA和RNA结合蛋白在紫外线照射下发生偶联,再经过蛋白特异性抗体将其沉淀,回收片段,再经添加接头,PCR扩增,进行高通量测序…
CLIP-Seq技术详解 CLIP (crosslinking-immunoprecipitation)是利用蛋白质和RNA在365nm紫外光照射下会发生共价交联的特性,来研究蛋白质和RNA相互作用的重要技术。 Clip主要用于分离和鉴定细胞中核糖核蛋白复合体中的RNAs、microRNAs以及蛋白复合物的方法。这个方法可以确定某些RBP是否能与特定的RNA结合并将RBPs与其结合的RNA...
CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughput sequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,可以高通量研究RNA结合蛋白在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
首先，m6A-seq 是一种高通量测序技术，通过特定的抗体识别并富集 RNA 分子中的 m6A 修饰，进而进行测序分析。这一方法允许科学家全面探索整个转录组中的 m6A 修饰位点，包括 mRNA、tRNA、rRNA、snRNA 以及长链非编码 RNA 等。m6A-seq 提供了对 m6A 修饰的全局视图，便于研究者深入理解 m6A 甲基化的...
CLIP-seq，全称为HITS-CLIP，是一种在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其核心原理在于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生耦联，通过RNA结合蛋白的特异性抗体，将RNA-蛋白质复合体进行沉淀，进而回收RNA片段。此过程需经历添加接头、RT-PCR等步骤，最终进行高通量测序。通过生物...
刚刚接触CLIP-seq实验或新加入实验室的小伙伴们,可能会感到有些迷茫。实验步骤复杂,资料难以找到,甚至有些教程需要付费。为了帮助大家更好地掌握CLIP-seq实验的基础知识和操作要点,我们特别邀请了高年级的硕博生来分享他们的经验,并设有答疑环节。 本次分享的内容包括: RNA结合蛋白的种类 🌱 CLIP-seq的分类和应用...