总之,Cistrome DB可以找我们感兴趣的转录因子以及组蛋白修饰位点的靶向基因信息,还可以通过toolKit进行可以检索哪个因子调控了我们感兴趣的基因、结合在该区域;查看哪些转录因子的结果与输入peak的结果有明显的重叠,可以用于转录因子的colocation分析。Cistrome...
第三,Toolkit从基因组片段集的层面帮助用户回答“What factors have a significant binding overlap with your peak set?”,在此功能中,用户可提交一个BED文件,该文件可以是某个转录因子ChIP-seq结果,则Cistrome DB Toolkit可帮助寻找到与该转录因子结合位点最相似的其他ChIP-seq数据,因而可用于寻找转录共调控因子;用...
GO结果 总之,Cistrome DB可以找我们感兴趣的转录因子以及组蛋白修饰位点的靶向基因信息,还可以通过toolKit进行可以检索哪个因子调控了我们感兴趣的基因、结合在该区域;查看哪些转录因子的结果与输入peak的结果有明显的重叠,可以用于转录因子的colocation分析。Cistrome-GO还可以做ChIP数据集靶基因的功能富集分析。大家是不是...