总之,Cistrome DB可以找我们感兴趣的转录因子以及组蛋白修饰位点的靶向基因信息,还可以通过toolKit进行可以检索哪个因子调控了我们感兴趣的基因、结合在该区域;查看哪些转录因子的结果与输入peak的结果有明显的重叠,可以用于转录因子的colocation分析。Cistr...
第一,Toolkit从基因层面回答用户“What factors regulate your gene of interest?”,在这个功能中,用户可输入任意的蛋白质编码基因,Cistrome DB Toolkit可返回按照调控潜能排序好的转录因子列表,并且用户可选择仅关注启动子调控,或是选择包含增强子的调控。第二,Toolkit从单个基因组区段的层面回答“What factors bind on...