外显子细胞质CircRNA是近几年来发现的一类新型,特殊的非编码RNA分子,通常是通过特殊的选择性剪接机制而产生的包含一个以上外显子环化构成环状RNA,几乎存在于所有物种,大量存在于真核细胞的细胞质中.现有研究表明,在人或动物中,其表达具有组织特异性和疾病特异性,有可能成为新型的分子标志物.vip基础医学与临床...
目前基于RNA-seq测序数据鉴定circRNA的方法主要是通过检测是否有read能匹配到back-splicing junction (BSJ) site,即circRNA的首和尾连接处的序列(具体如下图A中的右图所示)。 基于RNA-seq数据鉴定出circRNA后,如果想进一步确认鉴定结果的可靠性,还可通过实验来验证预测的circRNA。如通过PCR、Northern blot或RNA FISH...
siRNA:一类约21~25nt的RNA分子,由Dicer(RNAaseⅢ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成,通过完全互补配对的方式与目标mRNA结合,引起其降解,从而导致靶基因沉默。 ceRNA:competing endogenous RNAs,内源竞争RNA,ceRNA可以通过应答元件(microRNA response elements,MREs)与microRNA结合从而影响microRNA导致的基因沉默。
Circular RNA可以翻译成相应蛋白 Circular RNA能够和特定的miRNA结合,从而阻止miRNA去降解特定的mRNA,miRNA的一个重要功能是结合到特定mRNA的3’端,从而降解相应的mRNA。所以Circular RNA和相应的miRNA结合之后就可以调节mRNA的表达。 机制一:ceRNA机制(micro海绵机制) microRNA 与靶基因的3‘UTR区相结合,抑制靶基因表达...
circRNA是一类以共价封闭环为特征,广泛存在于真核生物中的新型RNA分子。CircRNA来源于基因的外显子或者内含子区域,在哺乳动物细胞中大量存在。现有研究表明大部分的circRNA在不同物种间是保守的。同时,由于其环状结构能抵抗RNase R的降解而比较稳定。circRNA由于其表达的特异性和调控的复杂性,以及在疾病发生中的...
【Circular RNA的产生机制】 Circular RNA,缩写为circRNA,中文名为环状RNA,属于非编码RNA,是近年的一个重要研究热点。 CircRNA主要是通过backsplicing的方式产生,明显不同于线性RNA(linear RNA)经典的5′–3′的模式。因此,circRNA不含有线性RNA的经典结构,如5′端加帽,3′端有poly A尾巴等,而是形成了一个环状。
顾名思义,非编码核糖核酸(RNA)为不进行蛋白翻译的一类RNA。目前非编码RNA包括tRNA(转录RNA),ribosomalRNA(核糖体RNA),microRNAs,long non-coding RNAs(长链非编码)以及circular RNA等。 长链非编码RNA可视化研究的意义以及RNAscope技术在其中的...
Circular RNA: metabolism, functions and interactions with proteins 特殊的环状结构使得circRNA能够避免诸多...
在前3篇推文中,我们总结了主要的circRNA功能、研究方法和形成机制,接下来我们来研读下2022年发表在著名国际期刊Nature Biotechnology上的一篇文献Engineering circular RNA for enhanced protein production。 为了最大化 circRNA 翻译效率,研究人员主要考虑了5个要素:载体拓扑结构、5'' 和 3'' 非编码区、内部核糖体进入...
为探究 circRNAs 在骨质疏松(OP)中对骨髓间充质干细胞(BMSCs)成脂成骨平衡及增殖的调控作用,研究人员开展了关于 Circular RNA circSTX12 的研究。结果发现 circSTX12 可调节 BMSCs 的分化和增殖,靶向 circSTX12 或为骨质疏松治疗新途径。广告 X 在骨骼的世界里,随着年龄增长,一场悄无声息的 “变革” 正在发...