外显子细胞质CircRNA是近几年来发现的一类新型,特殊的非编码RNA分子,通常是通过特殊的选择性剪接机制而产生的包含一个以上外显子环化构成环状RNA,几乎存在于所有物种,大量存在于真核细胞的细胞质中.现有研究表明,在人或动物中,其表达具有组织特异性和疾病特异性,有可能成为新型的分子标志物.vip基础医学与临床...
目前基于RNA-seq测序数据鉴定circRNA的方法主要是通过检测是否有read能匹配到back-splicing junction (BSJ) site,即circRNA的首和尾连接处的序列(具体如下图A中的右图所示)。 基于RNA-seq数据鉴定出circRNA后,如果想进一步确认鉴定结果的可靠性,还可通过实验来验证预测的circRNA。如通过PCR、Northern blot或RNA FISH...
Circular RNA可以翻译成相应蛋白 Circular RNA能够和特定的miRNA结合,从而阻止miRNA去降解特定的mRNA,miRNA的一个重要功能是结合到特定mRNA的3’端,从而降解相应的mRNA。所以Circular RNA和相应的miRNA结合之后就可以调节mRNA的表达。 机制一:ceRNA机制(micro海绵机制) microRNA 与靶基因的3‘UTR区相结合,抑制靶基因表达...
目前基于RNA-seq测序数据鉴定circRNA的方法主要是通过检测是否有read能匹配到back-splicing junction (BSJ) site,即circRNA的首和尾连接处的序列(具体如下图A中的右图所示)。 基于RNA-seq数据鉴定出circRNA后,如果想进一步确认鉴定结果的可靠性,还可通过实验来验证预测的circRNA。如通过PCR、Northern blot或RNA FISH...
circRNAs的形成依赖于侧翼RNA元件。侧翼RNA元件可能对内含子环化非常重要。研究发现一些circRNAs定位在细胞核中,可以与通过cis或trans作用模式调控宿主的转录活性。拟南芥的一个来源于SEP3基因6号外显子的circRNA可以结合到SEP3基因形成R-loop造成转录暂时停滞,而导致可变剪切过程跳过该外显子,产生缺少该外显子的转录本从...
circRNA是一类以共价封闭环为特征,广泛存在于真核生物中的新型RNA分子。CircRNA来源于基因的外显子或者内含子区域,在哺乳动物细胞中大量存在。现有研究表明大部分的circRNA在不同物种间是保守的。同时,由于其环状结构能抵抗RNase R的降解而比较稳定。circRNA由于其表达的特异性和调控的复杂性,以及在疾病发生中的...
在前3篇推文中,我们总结了主要的circRNA功能、研究方法和形成机制,接下来我们来研读下2022年发表在著名国际期刊Nature Biotechnology上的一篇文献Engineering circular RNA for enhanced protein production。 为了最大化 circRNA 翻译效率,研究人员主要考虑了5个要素:载体拓扑结构、5'' 和 3'' 非编码区、内部核糖体进入...
circular RNA三个显著特征:环状结构、无Poly A尾巴、非编码RNA。 相比线性mRNA分子,环状RNA生物稳定性高. 环状RNA生物学功能 miRNA海绵:环状可以吸附大量miRNA; 蛋白海绵:可以吸附大量蛋白; 翻译蛋白。 Circular RNA可以翻译成相应蛋白 Circular RNA能够和特定的miRNA结合,从而阻止miRNA去降解特定的mRNA,miRNA的一个重要...
circRNA(circular RNA,环状RNA)是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子,没有5′ 帽子结构和3′ poly(A)结构(如图1),主要位于细胞质或储存于外泌体中,不受RNA外切酶影响,表达更稳定且不易降解,已被证明广泛存在于多种真核生物体内[1]。大多数circRNA是由外显子环化而成,也有部分circRNA是由内含子环化而成的套索...
circRNA是一类以共价封闭环为特征,广泛存在于真核生物中的新型RNA分子。CircRNA来源于基因的外显子或者内含子区域,在哺乳动物细胞中大量存在。现有研究表明大部分的circRNA在不同物种间是保守的。同时,由于其环状结构能抵抗RNase R的降解而比较稳定。circRNA由于其表达的特异性和调控的复杂性,以及在疾病发生中的...