近日,来自韩国科学技术学院生物科学系的Yoon Ki Kim研究团队在MolecularCell杂志发表题为Circular RNAs trigger nonsense-mediated mRNA decay的研究论文,该研究揭示了circRNA通过与mRNA的3’UTR 相互作用,将EJC带近mRNA的3’端,从而触发EJC依赖的NMD(circNMD),导致mRN...
mRNA 是一种大的带负电荷的分子,不容易自然穿过细胞。脂质纳米颗粒(LNPs)是目前将 mRNA 输送到细胞中最常用的方法,但设计出既有效又安全的 LNPs 仍是一个持续研究的领域。 此外,mRNA 疫苗生产成本高昂,需要冷链储存,运输也比较困难,这使得将疫苗送达患者...
❝ 本文简单的介绍mRNA,miRNA,lncRNA及circRNA组测序原理、生信常规分析。 ❞ 转录组测序简介 「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合,所有RNA可分为「编码RNA」(mRNA)和「非编码RNA」(miRNA , piRNA, SiRNA, SnRNA,lncRNA, NAT, eRNA, circ RNA, ceRNAs等等)...
外泌体不管是在基础科研、临床应用,还是商业研发,都相当火热,BioWorld此次介绍一个非常好用的外泌体数据库:exoRBase,人类血液外泌体的RNA-seq数据分析的circRNA、LncRNA和mRNA的存储库,还包括已发表文献的实验验证。exoRBase对标准化RNA-seq数据的RNA表达谱进行了整合和可视化,数据涵盖了正常个体和不同疾病患者。数据...
microRNA(miRNA):长度22nt左右,是内源性非编码小RNA。其实除了mRNA,基本上其它RNA都是非编码RNA,不能决定蛋白的氨基酸序列。miRNA的功能主要是调控RNA的转录,通过结合mRNA导致基因沉默,即可以导致靶基因表达下调。 lncRNA:长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA,在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调...
如今,mRNA技术因为新冠疫情彰显了强劲的治疗实力,随之而来的,是带动了整个核酸药物产业的发展。在这个领域内,mRNA不再是唯一可以颠覆药物开发模式的技术,更多前沿的研究成果与科研技术正在涌现,颇受瞩目的便是环形RNA(circRNA)。 2021年,两起投资事件让环形RNA进入了大家的视野:美国初创公司Orna Therapeutics(Orna)宣布完...
而且,与线性mRNA不同,在circRNA中多用m6A修饰的核苷酸以保证环化效率和翻译水平。表2 识别不同核酸的基本模式识别受体(PRR)为了降低产品的免疫原性,减少dsDNA、dsRNA、ssDNA和DNA/RNA异二聚体副产物的产生及去除也是关键。现有手段包括,用DNase-I消除DNA污染物,降低Mg2+浓度或掺入修饰的核苷降低dsRNA的生成,用...
circRNA作为下一代RNA疗法的核心,有望治疗各种难治性疾病,包括病毒性传染病、肿瘤、病原菌感染、自身免疫性疾病、代谢性疾病等。 ▲circRNA的潜在应用 蛋白质替代疗法:其目的是恢复那些缺失或有缺陷的蛋白质功能,通常是由基因突变导致。采用mRNA治疗内源蛋白缺失已应用于多种疾病。相对于mRNA,circRNA结构具有更高的稳...
Alex Wesselhoeft表示,在 circRNA 序列中添加合适的 IRES(核糖体进入位点)序列,能够让 circRNA 表达蛋白,而且由于其比线性 mRNA 更稳定,因此能够在更长时间里表达更多蛋白,circRNA 作为一种新技术,将 mRNA 领域带入新阶段。 Orna Therapeutics 目前公布了4条研发管线,分别是 原位 CAR-T 细胞治疗、DMD 疗法、新冠...
1 circRNA生物合成的机制 目前,大多数circRNA是通过对前体mRNA(pre-mRNA)进行反向剪接而产生的,它们没有3′端和5′端[9]。根据其组成,circRNA可分为外显子-内含子circRNA(exon-intron circular RNA,EIciRNA)[10]、外显子circRNA(exonic circular RNA,ecircRNA)[9,11]和内含子circRNA(circular intronic RNA,ciRNA...