下面跟着小远一起看看，它是如何在植物中发挥作用的吧~01形成R-loop调控亲本基因的表达DNA：RNA杂交体和相关的单链DNA形成内源性三链核酸结构，称为R-loop。circRNA通过与亲本基因的基因组序列的碱基互补配对形成R-loop，从而调控亲本基因的表达。2021年5月，福建农林大学顾连峰课题组在Journal of Integrative Plant ...
随后作者构建circ-IRX7和circ-GUX1过表达载体,并将其转入原生质体中,通过DRIP-qPCR检测R-loop的含量、半定量PCR检测circRNA和亲本基因的表达水平(图5D-H)。结果表明,过表达circ-IRX7和circ-GUX1提高了R-loop的含量,抑制了亲本基因的表达。 图5 circRNA通过形成R-loop调控亲本基因的表达(Liu et al., 2021)。
CircR-loop是最近在环状RNA和DNA相互作用的调控机制中发现，是R-loop的一个子集。在动物和植物系统中，CircR-loop在关键调控功能中发挥着至关重要的作用。该研究领域始于circR-loop在人类线粒体基因组中的发现，circR-loop是线粒体DNA复制的关键。在植物界，circR-loop调控可变剪接和着丝粒分配等过程，分别影响着...
一方面,CircRNA可以与其产生位点形成R-loops,从而影响转录(图2A);此外,CircRNA可以与转录因子(TFs) 共激活来调节转录。 2.调控剪接 CircRNA可以在亲本基因位点促进环状外显子的跳跃。SEP3的第6外显子发生可变剪接,产生circSEP3(图2B)。circSEP3与其亲本DNA位点形成一个R-loop,导致转录暂停,形成交替剪接的SEP3.3 mR...
在动物和植物系统中,CircR-loop在关键调控功能中发挥着至关重要的作用。该研究领域始于circR-loop在人类线粒体基因组中的发现,circR-loop是线粒体DNA复制的关键。在植物界,circR-loop调控可变剪接和着丝粒分配等过程,分别影响着花发育的复杂性和基因组的稳定性。它们在动物领域也同样重要,circR-loop在癌症中与...
经检测，circRNA主要存在于细胞核中（图10h），所以SEP3外显子6 circRNA可能与DNA形成了RNA:DNA杂合体（R-loop）（图11a）。如何确定这种假设是否正确呢？用R-loop特异性抗血清S9.6进行斑点杂交（Dot-blotting），用RNase H（可在RNA:DNA杂合体中水解RNA）、RNase R（水解线性RNA，对circRNA无影响）和/或DNase...
调控转录与剪接:例如,ci-ankrd52与亲本基因座结合,形成R-loop,激活RNase H1介导ci-ankrd52酶切,破坏R-loop,促进转录延伸。circSEP3与亲本的DNA基因座形成R-loop,导致转录暂停,产生外显子跳跃突变体。 蛋白海绵:circMbl与MBL蛋白的反馈调控,MBL可结合在circMbl内含子的侧端,促进circMbl的合成;同时高表达的circMbl...
Circular RNA (circRNA) is a novel type of RNA that, unlike linear RNA, forms a covalently closed continuous loop, and is highly represented in the eukaryotic transcriptome. Most of these circRNAs are generated from exonic sequences, are conserved across species, and often show tissue/developmental...
Jorgen Kjems 等人发现,在 1% 琼脂糖凝胶中,相同长度的环状 T4lig2-CVB-GFP-circRNA(对 RNase R 降解耐受)和线性 T4lig2-CVB-GFP-Precusor RNA(对 RNase R 降解敏感)无法分开,电泳条带只有一条。在 2%琼脂糖凝胶中,尽管延长电泳时间(30/40/60min),但是,环状 CVB-GFP-circRNA 和线性T4lig2-CVB-GFP前...
相反,circRNA 仍旧保持环状 Loop 结构,使得其穿越凝胶孔隙摩擦力增加(在行为上,类似于未配对的双链 RNA 分子),相比对应的线性 RNA 分子,电泳迁移速率变更慢。此外,在变性凝胶条件下,circRNA迁移速率也明显比序列更长的前体Precusor RNA更加缓慢。E-Gel 凝胶是商业化的预制胶,其具体成分未披露。在 E-Gel 凝胶...