circBank数据库揭示了43701个circRNA-mRNA相互作用。然后,通过整合GSE97332数据集和GSE164803数据集的微阵列数据,选择了6个circRNA(hsa_circ_0003209、hsa_circ_0008128、hsa_circ_0020396、hsa_circ_0030051、hsa_circ_0034049和hsa_circ_00823...
1.创新点 首次在OA软骨细胞中发现了由16个differentially expressed circRNAs(DECs)、32个DETMs(target DEMs)和97个DETGs(target DEGs)构成的circRNA-miRNA-mRNA调控网络;hsa_circ_0027914、hsa_circ_0101125和hsa_circ_0102564被确定为在OA中的中心DECs。体外验证实验表明这三种中枢DECs的促凋亡功能及其作为OA新生物标...
输入文件表头 network_data<-read.csv("data.csv",header=TRUE) ②定义网络参数与属性: # 创建空的网络对象g<-graph.empty(n=length(c(unique(network_data$miRNA),unique(network_data$circRNA),unique(network_data$mRNA))),directed=TRUE)# 添加节点g<-g%>%set_vertex_attr("name",value=c(unique(netw...
由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络,以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用,并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。 他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a novel...
糖尿病及相关并发症中CircRNA-miRNA-mRNA的相互作用 MiRNAs被记录为通过控制信号级联中涉及的基因的上调或下调在糖尿病的发病机制中发挥重要作用。例如,miR375参与了胰腺细胞的发育。基于糖尿病及其相关并发症中miRNAs表达变化的特征,已经在电子数据库的帮助下从实验研究中浮现出来。
8). Conclusion:The construction of circRNA-miRNA-mRNA network provides a basis for the study of RNA interaction mechanism in AF, and circRNA may be a potential therapeutic target of AF.范吉林朱婷婷田晓玲刘思佳苏静张世亮Journal of Jilin University (Medicine Edition)...
糖尿病及相关并发症中CircRNA-miRNA-mRNA的相互作用 MiRNAs被记录为通过控制信号级联中涉及的基因的上调或下调在糖尿病的发病机制中发挥重要作用。例如,miR375参与了胰腺细胞的发育。基于糖尿病及其相关并发症中miRNAs表达变化的特征,已经在电子数据库的帮助下从实验研究中浮现出来。
在结直肠癌中研究人员也发现存在circRNA-miRNA-mRNA网络,circFMN2可通过miR-1182/hTERT轴促进结直肠癌细胞的增殖与迁移[20]。另外,circRNA-miRNA轴对肿瘤细胞增殖的影响在骨肉瘤、胰腺导管腺癌、神经胶质瘤、肝癌等多种恶性肿瘤中也被研究证实。 3.2 影响肿瘤细胞的迁移和侵袭 肿瘤的侵袭与转移是多因素相互作用的结果...
各种癌症的lncRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA网络挖掘 以乳腺癌(BC)为例子,文章是:Fan CN,et al. Systematic analysis of lncRNA-miRNA-mRNA competing endogenous RNA network identifies four-lncRNA signature as a prognostic biomarker for breast cancer. 2018 Sep 27;16(1):264. ...
竞争规则规定,当ceRNA的表达水平非常高时,ceRNA可以竞争与miRNA的结合并降低miRNA的表达水平。由于 miRNA 的表达水平较低,因此与其靶标 mRNA 结合的 miRNA 数量较少。因此,mRNA的表达水平变高。相反,当ceRNA的表达水平很低时,miRNA的表达水平就会很高;miRNA 的高表达水平导致 mRNA 的低表达水平。换句话说,circRNAs富...