本研究针对结肠癌(CRC)中PPARγ(Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ)的调控机制不明问题,通过整合RNA-seq与ChIP-seq技术,发现18个PPRE相关激酶差异表达基因(DEGs),鉴定出7个核心枢纽基因(PTK2/HGS/CDK8等),揭示其通过mTOR/PDGF等通路影响CRC进展。研究为PPAR
ChIP-seq 实验带来的海量数据向生物信息学 研究人员提出了新的挑战。由于此领域数据处理技术的发展大大滞后于实验技术进步, 有必要系统地介绍和回 顾ChIP-seq 数据处理的各个方面, 以便更多研究人员进入此领域设计或改进相应的算法。文章结合实例详细介 绍了ChIP-seq 数据整个流程, 并重点讨论了其中的主要问题和关键...
ChIP-Seq检测..ChIP-Seq检测注意事项ChIP-Seq(染色质免疫沉淀测序)用于研究蛋白质(如转录因子、组蛋白修饰)与DNA的相互作用,其成功依赖于严格的实验设计、抗体质量及数据分析策略。一、实验设计与样本准备
The analysis of ChIP-seq samples outputs a number of enriched regions, each indicating a protein-DNA interaction or a specific chromatin modification. Enriched regions (commonly known as "peaks") are called when the read distribution is significantly different from the background and its corresponding...
chip-seq文库制备 illumina平台 现货供应!!! 产品名称:TruSeq ChIP Library Preparation Kit - Set A 产品货号:IP-202-1012 产品规格:12 indexes, 48 Rxns 产品亮点: illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文库制备试剂盒用于Chlp来源DNA的染色质免疫沉淀测序文库制备。大约1.5天完成5ng DNA文库的制备。TruSe...
有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 chip-seq数据分析大体流程,引自微信公众号《生信技能树》 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控:fastp; 测序数据比对:bowtie2; 比对数据排序等:samtools; callPeaks:MACS3; 差异peaks寻找及作图:DiffBind;deeptools; ...
新闻 体育 汽车 房产 旅游 教育 时尚 科技 财经 娱乐 更多 无障碍 关怀版 登录 加载中... 00:00/00:00 推荐 加载更多 易基因 -【文献解读】第1节:ChIP-seq(组蛋白)植物育种论文深圳易基因科技 发布于:广东省 2022.11.04 16:21 分享到 热门视频 加载更多 ...
ChIP 分析的可靠性取决于抗体质量,包括特异性和信噪比( signal-to-noise ratio ,简称S/N)。由于来自非特异性抗体-DNA 结合的假阳性富集位点可能会混淆分析,意外的 ChIP-seq 结果应该使用多种抗体进行验证 虽然大多数 ChIP-seq 工具被设计用于位于特定基因组位置(如转录起始位点(TSSs))的尖峰,但是一些组蛋白修饰与...
评论 还没有人评论过,快来抢首评 发布 易基因-组蛋白ChIP-seq动物发育典型论文解析 深圳易基因科技 发布于:广东省 2025.05.07 16:18 +1 首赞 收藏 本期分享案例:精子组蛋白 H3K4me3作为父方肥胖的代谢传感器,与代谢功能障碍的遗传有关(IF=8.568) 推荐视频 已经到底了 热门视频 已经到底了 ...
毕业设计但是导师想发论文，我在伤脑细胞，刚刚接触，不是专业的 发自小木虫Android客户端 ...