在本研究中，作者鉴定出SLFN5的过表达抑制了HIV-1的复制并降低病毒mRNA水平，而内源性SLFN5缺失则促进...
CsSEP2过表达株系果长在三个阶段都没有发生变化,进一步支持果长变化是由SNP引起而不是基因表达量。CsSEP2在花和果实等生殖器官中高表达(图4A),令人惊讶的是,CsSEP过表达系很可能形成共抑制系,其中4种CsSEP基因的表达水平均出现不同程度的显著下降(图4B)。共抑制系中的花器官包括萼片、花瓣和雄蕊明显变大(图4C...
(2)检测目标基因的mRNA表达水平:RT-qPCR (3)检测目标基因蛋白质表达水平:Western blot 2、转录因子或组蛋白修饰添加基因的干扰实验(非靶向),验证是否影响目标基因表达和细胞功能 (1)转录因子或组蛋白修饰添加基因的干扰:基因的突变/敲降/敲除/过表达、相关蛋白的抑制剂 (2)检测TF结合/组蛋白修饰的整体变化:CHIP-...
ChIP-Seq强烈建议设置实验组别和生物学重复检测。 (2)蛋白表达和细胞量:细胞用量要不少于1E8(金标准:320g离心细胞量100μL,保障项目用量)。本底低表达的蛋白,建议使用过表达组进行检测。蛋白表达可根据WB结果或初步根据数据库判定(Proteomics DB,ProteomicsDB;Human Protein Atlas,The Human Protein Atlas (3)抗体关...
4、ChIP-seq技术可研究DNA的甲基化情况,DNA甲基化会引起染色体结构、DNA构象、DNA稳定性以及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。 针对ChIP-seq这4个方面的应用,为了让大家能更好地理解文献举例里面的内容,小远决定在这里先给大家把基础打牢,如果不清楚基本概念,那么有些实验结果可能会比较难理解,所以...
通过ChIP-seq数据与基因表达进行关联分析，可以进一步研究组蛋白修饰/转录因子是如何调控下游基因。基于多...
解析转录因子如何与 DNA 互作以调节基因表达的过程对于深入理解多种生物过程和疾病状态至关重要。在此过程中,Chip-seq 技术能够发挥关键作用。 组蛋白修饰 染色质是指间期细胞核内由 DNA、组蛋白、非组蛋白及少量 RNA 组成的线性复合结构,是间期细胞遗传物质存在的形式。
而Tho2缺失通过诱导Nrd1在染色质上的任意结合来响应Nrd1过表达效应。全基因组ChIP-seq分析揭示在Tho2缺失后,Nrd1对与衰老相关的翻译相关基因招募增加。本研究结果强调了Tho2介导的Nrd1通过衰老相关基因转录调控在寿命通路调控中的重要性。这项研究提供了对衰老分子机制的新见解,特别是关于RNA代谢和转录调控如何与衰老...
过表达H19对Tesc H3K27me3或mRNA表达没有影响(图2F)。已知Tescalcin可通过抑制钙调神经磷酸酶和使GSK3保持其活性形式来磷酸化NFAT来进行核排斥,从而作用于NFAT通路。 因此,作者测试了Nfatc3的表达和活性,通过WB和ChIP-qPCR发现敲低H19后Nfatc3蛋白水平升高,Nppb和Mcip1.4靶启动子上的Nfatc3活性升高(图2G,H...