MAnorm2设计了一个经验贝叶斯框架,利用拟合均值-方差曲线来给单个区域的组内变化水平赋予一个先验分布,并进一步通过平衡先验和后验观测来更准确地估计ChIP-seq信号的组内变化水平,从而提高对组间差异ChIP-seq信号的灵敏度(图一)。
产品描述:The EpiNext ChIP-Seq High Sensitivity Kit (Illumina) contains all necessary reagents required for carrying out a successful ChIP-Seq starting from mammalian cells or tissues. In the ChIP reaction, chromatin is isolated from cell/tissues and the target protein-DNA complex is immunoprecipitate...
在ChIP-seq数据标准化这一步,MAnorm2沿用了MAnorm的核心假设(即当两个样本间存在大量共有峰(common peaks)时,认为它们在这些区域的信号强度总体上没有变化,进而通过绘制传统M-A图并对共有峰M值和A值之间的相关性进行线性拟合来获得...
MAnorm2设计了一个经验贝叶斯框架,利用拟合均值-方差曲线来给单个区域的组内变化水平赋予一个先验分布,并进一步通过平衡先验和后验观测来更准确地估计ChIP-seq信号的组内变化水平,从而提高对组间差异ChIP-seq信号的灵敏度(图一)。