ATACseq- 使用转座酶并提供一种同时从单个样本的转录因子结合位点和核小体位置提取信号的方法。3. Work...
这也就决定了ATAC-seq与Chip-seq call出来的peak代表的意义不同。 Chip-seq peak是被目的蛋白结合拉下来的DNA,一般只有一个峰,而ATAC-seq是被Tn5转座酶切开、没有被组蛋白结合、染色质开放的DNA位点,如果是TF结合的区域,一般会有一个山谷般的存在。 ChIP-seq和ATAC-seq在TF或者Tn5结合区域都会形成一个双峰的r...
ChIP-seq：直接检测与转录因子结合的DNA序列，但一次测序只能提供一个转录因子的信息，检出率相对较低。D...
ATAC-seq 技术检测染色质开放区域，即T5酶可接近的 DNA 区域，将快速又敏感的表观遗传现象可视化。使用...
ChIP-Seq和ATAC-Seq的主要区别在于它们的应用场景、检测对象和目的。ChIP-Seq主要用于检测特定转录因子与DNA的相互作用。它需要明确知道感兴趣的转录因子是什么,然后根据该转录因子设计抗体去做ChIP实验,从而验证这个转录因子是否与DNA存在相互作用。ATAC-Seq则是一种全基因组范围内检测染色质开放程度的方法,可以得到全基...
研究目的不同： ATAC-seq对标DNase-seq，研究 open chromatin；ChIP-seq是很老的技术了，研究...
ATAC-seq是经典的研究染色质开放性手段，将其结果与转录组或其他表观组学关联，即可获得染色质开放性对...
ATAC-seq 分析流程 （from Novogene）与其他常用技术的比较：ChIP-seq：直接检测与转录因子结合的DNA序列...
ATAC-Seq与ChIP-Seq的不同的是ATAC-Seq是全基因组范围内检测染色质的开放程度，可以得到全基因组范围内...
ChIP-Seq是揭示特定转录因子或蛋白复合物的结合区域，实际是研究DNA和蛋白质的相互作用，利用抗体将蛋白质...