在 ChIP-PCR 或 ChIP-seq 中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂和下一代测序 (NGS) 技术便能检测和定量免疫富集的 DNA 片段。ChIP 可以用来回答大量涉及蛋白和染色质相互作用的科学问题。例如,ChIP 可用来比较某些蛋白在各位点上的存在情况,绘制某个目的基因组区域内的各种蛋白图,或定量能够在受到刺激一段时间后...
RIP-Seq是一种检测细胞内蛋白/RNA互作组的高通量技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和RNA测序技术对目的蛋白在特定细胞/组织内的互作蛋白/RNA,进行系统的检测和分析。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/RNA互作组数据检测,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异研究。因此,该技术是研究细胞内蛋白/RN...
1.酵母单杂交技术酵母单杂交技术是1993年由酵母双杂交技术发展而来的,其基本原理为:真核 生物基因的转录起始需转录因子参与,转录因子通常由一个DNA特异性结合功 能域和一个或多个其他调控蛋白相互作用的激活功能域组成,即DNA结合结构 域D
5)Pull-down及免疫共沉淀(CoIP)实验进一步证明了bHLH48或bHLH60可以与PIF7结合。 上述结果表明,bHLH48和bHLH60可以直接与PIF7相互作用,转录激活功能可能需要蛋白间相互作用实现。 五、ChIP-seq及相关实验证明bHLH60与PIF7共同调控靶标基因的表达 1)作者...
RNA-seq发现敲除NCoR/SMRT可在重编程后期激活多能性基因基因过表达/干扰结果显示NCoR/SMART抑制重编程需要借助HDAC3去乙酰化酶活性H3K27ac的ChIP实验表明HDAC3通过诱导多能基因位点的组蛋白去乙酰化来抑制重编程NCoR/SMRT的ChIP实验表明NCoR/SMRT通过HDAC3介导的组蛋白去乙酰化抑制多能基因激活COIP和ChIP等表明c-MYC与...
ChIP-qPCR的富集实验与ChIP-seq实验一致。 1、首先是利用1%的甲醛对样本进行交联,以固定蛋白-DNA的结合状态; 2、随后对染色质进行提取和片段化(超声打断或酶切),此时取出一部分染色质(一般是2%Input),对DNA进行纯化,即为Input; 3、对部分染色质进行目标蛋白抗体的孵育与磁珠富集,解交联后纯化DNA,即为IP;同时,...
研究方法:acRIP-seq、mRNA-seq、CHIP-seq、Coip-MS 研究主题: 本研究旨在阐明NAT10在心肌铁下垂中的作用及其机制。研究结果揭示了p53和NAT10相互依赖地合作形成一个正反馈途径,促进心肌细胞铁下沉,加剧心脏I/R损伤。该研究成果提供了靶向NAT10/Mybbp1a/p53可能是治疗心脏I/R的新方法 ...
因此,ChIP-Seq是研究细胞内蛋白/DNA互作调控网络的常规前置技术。ChIP-qPCR是一种检测细胞内蛋白/DNA互作的靶向验证技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和qPCR检测技术,对目的蛋白在特定细胞/组织内的蛋白/DNA互作关系进行探究,验证蛋白/DNA的相互作用关系。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/DNA互作验证,或...
CoIP验证 FOXA1和TET1相互作用；进一步沉默FOXA1和TET1后，LIG1表达降低，证实在耐药株中FOXA1/TET1复合体协同调控LIG1表达。进一步通过 ChIRP和RIP实验 证实circRNA能够与FOXA1和TET1蛋白结合。图4. 通过ChIP和双荧光素酶试验验证circRNA影响FOX1/TET1结合LIG1启动子（Ref. Fig.7）。调控复合体功能：ChIP实验证实FOX...
云序作为一家依托于高通量测序的科研服务公司,除了提供优质测序服务,还为客户提供机制研究的服务,助力用户发表高分文章,其中包括研究蛋白互作的CoIP技术、RNA与蛋白/RNA互作的RNA pull-down技术、蛋白与DNA互作的ChIP和ATAC技术,近期更推出了新一代ChIP-seq技术Cut&Tag,囊括了DNA、RNA和蛋白质这三类经典大分子互作研究...