Chip和Chip-seq是常用于研究基因组中染色质和蛋白质相互作用的实验技术。Chip实验用于检测染色质中特定蛋白质与DNA之间的相互作用。该技术通过使用特异性抗体与染色质中的目标蛋白质结合,并利用免疫沉淀、洗涤和DNA提取等步骤来分离和富集特定DNA序列。通过这种方式,可以获取与目标蛋白质结合的DNA序列。Chip...
方案:针对这个痛点,广州基云生物重点推出“互作机制研究系统性解决方案”,包括免疫沉淀试验(IP、RIP、CHIP、CHIRP)和蛋白组芯片检测试验,协助轻松突破互作机制,让科研成果更上一层楼。ChIP-Seq互作组验证,即在互作组分析筛选的基础上,进一步利用ChIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测,更加精细,也是互作组验证的...
染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效...
1. ChIP-chip和ChIP-Seq数据的处理和预处理:包括质量控制、序列比对、峰识别、数据归一化、差异分析等内容。 2. ChIP-chip和ChIP-Seq数据的生物学解释和功能注释:利用公共数据库和生物信息学分析工具对ChIP-chip和ChIP-Seq数据进行基因富集分析、通路富集分析、转录因子富集分析等功能注释。 3. ChIP-chip和ChIP-Seq...
介绍了如何将ChIP-seq、MeRIP-seq等富集峰及eccDNA形象地展示在染色体上,在染色体水平查看peak的分布和规律,操作步骤和注意事项。, 视频播放量 8820、弹幕量 0、点赞数 20、投硬币枚数 6、收藏人数 36、转发人数 15, 视频作者 微生信课堂, 作者简介 微生信,0代码在线绘制
ChIP-qPCR和ChIP-Seq产地:全国; 品牌:研载生物 PIPES指数:1.0 用户:0 新闻:0 应用:0 产品描述 一、技术简介 ChIP(染色质免疫共沉淀)是检测体内条件下DNA与蛋白质相互作用的方法,采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀,由此可以把目的蛋自所结合的基因组DNA片段也富集下来。ChIP-qPCR可以对目的片段进行定量分析,...
ChIP-Seq:用于构建目的蛋白的DNA互作组数据,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。 ChIP-qPCR:用于验证目的蛋白和候选DNA的相互作用关系,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作变化。 ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证技术价值: (1)蛋白与DNA相互作用数据,是探究转录调控机制研究的重要内容,体现机制研究的深度,能...
ChIP-seq或染色质免疫沉淀和测序是一种技术,允许研究人员通过在全基因组范围内绘制蛋白质-DNA相互作用和表观遗传标记来理解转录调控。与以前的方法相比,ChIP-seq具有几个优点,例如ChIP芯片,但与所有技术一样,ChIP-seq也有其局限性。 ChIP-seq ChIP-seq是下一代测序的首批应用之一,该测序是在2000年代中期开发的。其...
ChIP 实验设计指南 (1)测序和文库复杂性 对于每个哺乳动物基因组的ChIP-seq点源库,ENCODE的目标是在每次重复中获得≥10M唯一比对reads,以及目标NRF(非冗余分数)≥0.8。modENCODE点源因子的相应目标是每次重复获得≥2M唯一比对reads,≥0.8 NRF。果蝇中的广源ChIP-seq,modENCODE目标reads是≥5M,哺乳动物广源组蛋白标记...
ChIP概述: 全基因组ChIP实验的目标是定位整个基因组中具有最大信噪比和完整性目标蛋白的结合位点。ChIP-seq的基本流程如图1A所示。用化学试剂处理细胞或组织,使蛋白质与DNA共价交联。然后是通过细胞破碎和超声处理,或是酶解(某些情况),将染色质剪至100-300bp大小。再通过靶向该因子的特异性抗体纯化目标蛋白(转录因子、...