Chip和Chip-seq是常用于研究基因组中染色质和蛋白质相互作用的实验技术。Chip实验用于检测染色质中特定蛋白质与DNA之间的相互作用。该技术通过使用特异性抗体与染色质中的目标蛋白质结合，并利用免疫沉淀、洗涤和DNA提取等步骤来分离和富集特定DNA序列。通过这种方式，可以获取与目标蛋白质结合的DNA序列。Chip...
ChIP-Seq是将回收纯化的DNA进行建库测序,用于发现目的蛋白潜在结合的DNA序列。 目前ChIP技术已广泛应用于组蛋白修饰、转录因子作用位点和DNA甲基化等研究中。相比其他DNA与蛋白相互作用的研究方法,ChIP的突出优势在于通过检测蛋白与DNA的结合,研究体内真实情况下的染色质结构,从而得出确凿的诱导或阻碍转录的证据,这对构架...
染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效...
转录因子ChIP-seq (TF ChIP-seq) 处理流程适用于预测以点状方式结合的蛋白质,例如特定 DNA 序列或特定染色质结构。其中,IP标靶通常是已知或推定的转录因子或染色质重塑蛋白,也可以是 RNA 结合蛋白、其他 DNA 或染色质特异性因子。 (2)处理流程 组蛋白ChIP-seq和转录因子ChIP-seq的流程具有相同的比对步骤,但在信...
本研究通过整合RNA测序、蛋白质组学分析、ChIP-seq、ATAC-seq数据以及实验验证强调了两个AP2抑制因子在协调特定发育阶段遗传程序表达中的作用,从而揭示它们对弓形虫生殖细胞发育过程的影响。 主要研究结果 1. AP2介导裂殖子基因沉默 裂殖子作为启动有性生殖的关键阶段,具有独特的转录特征。在本研究中,我们筛选出一...
1. ChIP-chip和ChIP-Seq数据的处理和预处理:包括质量控制、序列比对、峰识别、数据归一化、差异分析等内容。 2. ChIP-chip和ChIP-Seq数据的生物学解释和功能注释:利用公共数据库和生物信息学分析工具对ChIP-chip和ChIP-Seq数据进行基因富集分析、通路富集分析、转录因子富集分析等功能注释。 3. ChIP-chip和ChIP-Seq...
以表观组学研究中的ChIP-seq为例,ENCODE Consortium使用不同的表观基因组分析,并制定对应的分析方案和指南,具有绝对的权威和参考意义。 本期,易基因小编为大家说明ENCODE数据库的组…
ChIP-Seq:用于构建目的蛋白的DNA互作组数据,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。 ChIP-qPCR:用于验证目的蛋白和候选DNA的相互作用关系,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作变化。 ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证技术价值: (1)蛋白与DNA相互作用数据,是探究转录调控机制研究的重要内容,体现机制研究的深度,能...
ChIP-seq或染色质免疫沉淀和测序是一种技术,允许研究人员通过在全基因组范围内绘制蛋白质-DNA相互作用和表观遗传标记来理解转录调控。与以前的方法相比,ChIP-seq具有几个优点,例如ChIP芯片,但与所有技术一样,ChIP-seq也有其局限性。 ChIP-seq ChIP-seq是下一代测序的首批应用之一,该测序是在2000年代中期开发的。其...
方案：针对这个痛点，广州基云生物重点推出“互作机制研究系统性解决方案”，包括免疫沉淀试验（IP、RIP、CHIP、CHIRP）和蛋白组芯片检测试验，协助轻松突破互作机制，让科研成果更上一层楼。ChIP-Seq互作组验证，即在互作组分析筛选的基础上，进一步利用ChIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测，更加精细，也是互作组验证的...