一、介绍ChIP-seq,测序方法ChIP 指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),seq 指的是二代测序方法作用:识别蛋白质与DNA互相作用情况原理:染色质免疫共沉淀 + 二代测序应用:常用于转录…
CHIP-seq原理是通过染色质免疫共沉淀技术特异性富集目的蛋白结合的DNA片段,并进行高通量测序,以研究蛋白质与DNA的相互作用。分析步
一、chip-seq的原理: (1)ChIP-Seq(染色质免疫沉淀测序)是一种用于研究蛋白质与染色质相互作用的高通量测序技术;可视作染色体免疫共沉淀技术与二代测序技术的结合;ChIP可用于检测某种特异蛋白或某种特异蛋白修饰在某个基因组区域的相对丰度,可用来回答涉及蛋白质和染色质相互作用的问题; (2)ChIP用来确定蛋白质与DNA...
ChIP-seq服务流程 客户在线下单——订单/实验材料确认——细胞培养——1%甲醛交联蛋白-DNA复合物——超声打断蛋白-DNA复合物——抗体沉淀蛋白-DNA复合物——解交联并纯化DNA片段——文库构建——Hiseq上机测序、数据质控 其中文库构建流程：（1）DNA片段末端修复；（2）3’端加A碱基；（3）连接测序接头；（4）PCR...
由于二代测序技术的巨大进步,ChIP-seq比其最初版本ChIP-chip具有更高的分辨率、更低的噪声和更大的覆盖范围。随着测序成本的降低,ChIP- seq已成为研究基因调控和表观遗传机制不可或缺的工具。 原理 甲醛处理细胞使目标蛋白与DNA交联,通过超声波将交联后的染色质打断成小片段,一般在200-600bp范围内。再利用抗原...
seq指的是二代测序方法 作用:识别蛋白质与DNA互相作用情况 原理:染色质免疫共沉淀 + 二代测序 应用:常用于转录因子结合位点和组蛋白修饰位点的研究 二、测序原理 1、使用甲醛将目标蛋白(组蛋白,转录因子等)与染色质交联固定起来 mark 2、从细胞裂解液分离基因组DNA,通过超声打断DNA为一定长度的小片段 ...
ChIP-seq,全称染色质免疫沉淀测序,是一种强大的技术,用于探索特定转录因子(TFs)在基因组中的结合位点。以下是该技术的详细步骤和分析流程: 实验步骤 🧪 固定蛋白质与DNA:通过甲醛稳定蛋白质与DNA之间的连接,形成DNA-蛋白质交联。 超声波裂解:在裂解缓冲液中利用超声波分解与蛋白质结合的DNA。
Chip-seq的原理主要包括以下几个步骤:样品处理、免疫沉淀、DNA提取、测序和数据分析。 首先,样品处理是为了获得高质量的细胞或组织样品。样品要经过交联处理,将蛋白质与DNA交联在一起,然后通过细胞裂解和核蛋白提取等步骤,将染色质释放出来。 接下来,免疫沉淀是将特定的抗体与目标蛋白质结合,形成抗体-蛋白质复合物。