技术平台:Co-IP、ChIP-seq、RNA-seq等 研究对HEK293T细胞使用GR和TET家族蛋白(TET1、TET2、TET3)抗体进行共免疫沉淀(Co-IP)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq);通过Connectivity Map数据库,利用HEK293和HCT116细胞系中GR和TET2的共有靶基因以及CRC差异表达基因(DEGs)进行药物再定位;在表达GR水平不同的CRC细胞系(即...
ChIP-seq 、CLIP-seq和Co-IP ChIP-seq：沉淀目的蛋白，对DNA进行测序，所以是检测蛋白质与基因组的哪...
RIP技术下游结合microarray技术(微阵列)被称为RIP-Chip,帮助我们更高通量地了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。 CoIP(免疫共沉淀法): 免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CO-IP)是利用抗原与抗体之间的专一性作用,用于研究蛋白质与蛋白质之间相互作用的经典方法。利用免疫共沉淀可以检测两个已知蛋白之间的相互作用,...
技术平台:Co-IP、ChIP-seq、RNA-seq等 研究对HEK293T细胞使用GR和TET家族蛋白(TET1、TET2、TET3)抗体进行共免疫沉淀(Co-IP)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq);通过Connectivity Map数据库,利用HEK293和HCT116细胞系中GR和TET2的共有靶基因以及CRC差异表达基因(DEGs)进行药物再定位;在表达GR水平不同的CRC细胞系(即...
共免疫沉淀(Co-IP):研究GR与TET家族蛋白之间的互作。 RNA-seq和ChIP-seq测序:分析GR和TET蛋白的共有靶基因。 药物再定位:利用Connectivity Map数据库,基于GR和TET2共有靶基因进行药物再定位分析。 结果图形 (1)GR表达作为糖皮质激素诱导细胞迁移的中介及其对结直肠癌患者生存的影响;与GC促进CRC细胞迁移相关的GR相...
Co-IP和ChIP-seq分析验证了HEK293T细胞中GR和TET家族蛋白之间的互作。所选化合物Belinostat成功验证了其抗GC诱导的CRC细胞侵袭潜力。对Belinostat处理的HCT116细胞转录组分析揭示了与癌症转移相关的靶基因下调。 本研究研究为理解GC诱导转移的分子机制提供了宝贵的见解,引入了可能作为GC治疗潜在辅助疗法的新定位化合物。
技术平台:Co-IP、ChIP-seq、RNA-seq等 研究对HEK293T细胞使用GR和TET家族蛋白(TET1、TET2、TET3)抗体进行共免疫沉淀(Co-IP)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq);通过Connectivity Map数据库,利用HEK293和HCT116细胞系中GR和TET2的共有靶基因以及CRC差异表达基因(DEGs)进行药物再定位;在表达GR水平不同的CRC细胞系(即...
利用酶联免疫(ELISA)、免疫共沉淀(CO-IP)技术都是利用抗原和抗体间的免疫反应,可以研 究抗原和抗体之间的相互作用,但是,它们都是基于体外非细胞的环境中研究蛋白质与蛋白 质的相互作用。而在细胞体内的抗原和抗体的聚积反应则可以通过酵母双杂交进行检测 酵母三杂 酵母双杂交系统是研究蛋白间相互作用的有用工具,...
技术平台:Co-IP、ChIP-seq、RNA-seq等 研究对HEK293T细胞使用GR和TET家族蛋白(TET1、TET2、TET3)抗体进行共免疫沉淀(Co-IP)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq);通过Connectivity Map数据库,利用HEK293和HCT116细胞系中GR和TET2的共有靶基因以及CRC差异表达基因(DEGs)进行药物再定位;在表达GR水平不同的CRC细胞系(即...
应用:验证ChIP-seq数据中的特定结合位点,或者在没有进行全基因组测序的情况下,检测特定区域的蛋白质-DNA相互作用。 (2)Co-IP (共免疫沉淀): 原理:使用一种特异性抗体捕获目标蛋白及其相互作用的伴侣蛋白,从而鉴定蛋白质复合物。 应用:研究蛋白质-蛋白质相互作用,特别是在表观遗传调控复合物的研究中非常有用。