染色质免疫沉淀-测序(Chip-sequencing,简称 Chip-seq)用于分析蛋白质与 DNA 的交互作用。此技术结合了染色质免疫沉淀(Chip)和高通量 DNA 测序,旨在鉴定与 DNA 结合的蛋白质位点,从而精确绘制全基因组上目标蛋白的结合区域。在 Chip-seq 出现之前,Chip-on-chip 技术是研究蛋白质-DNA 相互作用的常用方法。 Chip(染...
染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)是研究表观遗传调控的重要手段之一,它广泛用于全基因组组蛋白修饰、转录因子和其他蛋白-DNA互相作用研究。ChIP-seq作为爱基百客的王牌产品,已用多篇项目文章证明实力。 组织水平的ChIP-seq技术需要使用超声/酶切打断交联的基因组片段,然后用特异性抗体富集含有目的蛋白结合的基因组片段,...
首先聊聊转录因子的ChIP-seq: 我们要知道转录因子(Transcription factor,TF)是能够结合在某基因上游5’端特异序列上的蛋白质,它作为反式作用因子,与真核基因的顺式作用元件比如启动子、增强子等发生特异性相互作用,从而激活或者抑制基因的转录。所以我们看那些高分paper里做转录因子的ChIP-seq,主要就是用来确定靶蛋白也...
为了帮助大家理解,小远在解析表观遗传学的工具——ChIP-seq(一)中介绍了许多基础知识,有了基础知识做铺垫很多东西理解起来就会更加容易。当时由于篇幅的原因,有些知识点只是简单提了提,没有具体展开,而今天的内容主要是给大家介绍ChIP-seq应用的一些文献实例,如果在这个过程中涉及到一些比较重要的知识点,小远还是会...
问题一：ChIP-seq从样本准备到拿到测序结果整体流程是怎样的？使用甲醛固定细胞，将DNA与蛋白质交联；裂解...
靶下切割和核酸酶释放(Cut&Run)与CHIP-seq一样，用于检测DNA与蛋白质的相互作用，它不需要甲醛交联和...
ChIP-seq:利用染色质免疫共沉淀+高通量测序研究某种蛋白质结合的基因组区域 染色质由DNA、组蛋白等组成: 1.png DNA将组蛋白“打包”,起到调控基因比如激活/沉默的作用: 2.png 1. 甲醛交联:将所有蛋白和其结合的DNA固定下来 包括目标蛋白: 3.png
Chip-seq是一种结合了染色质免疫沉淀(ChIP)和高通量测序(sequencing)的技术,用于研究特定蛋白质与DNA之间的相互作用。通过该技术,我们可以确定蛋白质与DNA的结合位点,并进一步了解这些结合位点在基因调控中的作用。 二、实验步骤 1. 交联:首先,将细胞或组织交联,使DNA与蛋白质相互交联形成复合物。这一步骤可以使用甲...