ChIP-Seq分析和作用 1:ChIP-Seq数据是基因组特异性富集的序列的测序结果,包括组蛋白修饰ChIP-Seq(H3K4me3/启动子相关/narrowpeak、H3K4me1/增强子相关/narrowpeak、H3K27ac/增强子相关/broadpeak)、转录因子ChIP-Seq(CTCF/绝缘子相关/narrowpeak、pol II/转录起始/narrowpeak)、DNA富集序列(DNase-Seq/弱DNA酶消化/...
chip-seq是一种高通量的基因组学研究方法,用于研究蛋白质与dna在染色质上的相互作用.chip-seq试剂盒是进行chip实验所需的所有试剂和组件,如抗体,磁珠,洗脱液,酶等.chip-seq试剂盒的设计旨在简化实验过程,提高实验的可重复性和准确性. ...
关于易基因染色质免疫共沉淀测序 (ChIP-seq) 染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基...
本研究揭示了水稻种子ABA信号通路中,ZFP36作为转录因子作用于OsAPX1启动子,促进OsAPX1表达、增强APX酶活性,从而可以减少ROS和ASC以抑制种子萌发,且OsLEA5可与ZFP36结合促进这种抑制作用。创新点 本研究从ABA信号通路中起重要作用的转录因子ZFP36入手,通过ChIP-Seq准确定位ZFP36的靶向基因OsAPX1及结合位点,并结合酵...
研究中的应用染色质免疫共沉淀(chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技术是研究体内蛋白质与DNA之间相互作用的强有力工具,在转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究中被广泛应用。 最近诞生的染色质免疫共沉淀测序(chromatin immunoprecipitationsequencing,ChIP Seq)技术充分结合了ChIP和高通量测序技术的优势,能够在全基因...
与传统的ChIP-seq相比,DAP-Seq不受抗体和物种的限制,使得研究者能够探索更广泛的生物体系。 DAP-Seq的优势高通量检测: DAP-Seq能够一次性检测成千上万的转录因子结合位点,大大提高了研究的效率。无需特异性抗体: 这一技术不需要为每个转录因子制备特异性抗体,节约了宝贵的时间和资源。跨物种应用: 无论是模式物种...
DNA相互作用对于研究细胞各项过程有着重要的作用.染色质免疫共沉淀及后续的测序提供了一个研究蛋白质-DNA相互作用的强有力的工具.它可以检测活细胞内结合在特定序列上的蛋白.特别是,针对整个基因组上不同转录因子的ChIP抗体需求量很大,它们可以帮助研究基因组范围内的转录因子结合位点.ChIP分析要求参与实验的DNA含有的...
该研究作者通过ChIP-seq和RNA-seq联合分析获得了转录因子CsAtf1的靶基因CsCyp51G1,通过研究进一步揭示了暹罗炭疽菌对咯菌腈反应的作用机制。爱基百客为该研究提供ChIP-seq、RNA-seq的技术支持。 研究思路 研究结果 一、CsAtf1调控的下游靶基因的鉴定 为了深入了解CsAtf1的调节功能,对野生型和∆CsAtf1突变株进行...
研究技术:TChAP、ChIP-seq、RNA-seq 01 研究背景 在所有真核生物中,遗传信息从一代到下一代的忠实传递在很大程度上依赖于准确的DNA复制。一些因素,包括嘧啶二聚体,未修复的DNA损伤,RNA-DNA杂交和DNA二级结构的形成,可以破坏或减缓DNA复制。这些因素可能导致分叉停滞,导致复制胁迫,进而影响基因组完整性。