ChIP-qPCR是一种研究细胞内蛋白与DNA相互作用的检测技术。它结合了免疫共沉淀和qPCR方法，旨在揭示目的蛋白在特定细胞或组织中与DNA的结合情况。通过此技术，科学家可以验证蛋白与DNA的相互作用，并应用于研究特定细胞或组织中蛋白-DNA互作的验证，以及不同遗传背景或实验条件下互作的差异。ChIP-qPCR在研究细...
微基生物可以利用qPCR定量检测样本中的碳循环、氮循环、硫循环等过程中的功能基因。
qPCR可以对目的片段进行定量分析。通过对目的序列的扩增,并与Input、阳性对照和阴性对照的量对比,就可以证明目的蛋白是否与预想的DNA序列发生了相互作用。 ChIP-Seq 是将回收纯化的DNA进行建库测序,用于发现目的蛋白潜在结合的DNA序列。 好多小伙伴ChI...
本期将重点介绍蛋白质与DNA相互作用的研究方法,染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是目前唯一研究二者互作关系的技术。ChIP可以完整真实地反映细胞中特定蛋白与DNA的结合关系,将蛋白-DNA复合物分离出来进一步研究特定的结合蛋白或与其结合的DNA,结合qPCR(ChIP-qPCR)可实现定量分析,结合二代测序(ChIP-...
qPCR可以对目的片段进行定量分析。通过对目的序列的扩增,并与Input、阳性对照和阴性对照的量对比,就可以证明目的蛋白是否与预想的DNA序列发生了相互作用。 ChIP-Seq 是将回收纯化的DNA进行建库测序,用于发现目的蛋白潜在结合的DNA序列。 03 Covaris AFA技术在ChIP的作用与优势 ...
ChIP-qPCR 数据需要针对可变性来源进行标准化,包括染色质数量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。 两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和富集倍数法(Fold Enrichmen)。与input相关的ChIP-qPCR数据包括ChIP的背景水平和input染色质的标准化。建议ChIP 实验重复,尽可能将结果与背景信号和标准...
ChIP-qPCR结果展示模式可视化如下: Cell 2011 1,最上一栏,为基因组功能序列注释的排列。 2,下4栏为4种不同基因组DNA结合蛋白进行ChIP实验的结果展示。(横标为基因组位置,纵标为Inp,相较与背景DNA的“倍数”) 3,A-I柱图表示不同DNA区域。样本差异程度通过星号*来标识。
ChIP-qPCR是一种结合了染色质免疫沉淀(ChIP)与实时荧光定量PCR(qPCR)的技术。它用于检测特定蛋白质(如转录因子)与特定DNA序列的结合情况,通过ChIP富集与目的蛋白结合的DNA片段,随后用qPCR技术对这些片段进行定量检测,以验证蛋白质与特定基因区域的结合关系。ChIP-qPCR适用于已知蛋白质与靶序列相互作用的研究,具有较高...
1、 CHIP-qPCR 研究 VCaP细胞在有或无E2处理时 ERα 聚集到 NEAT1 启动子区。 image.png IgG或ERα抗体沉淀下复合物后,针对猜测的DNA序列设计引物检测是否有特定的DNA序列与Erα结合。适用于想要研究某个特定蛋白是否结合自己猜测的基因。需要针对基因不同区段设计引物。